18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0288 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0288    100 
 
 
606 bp  1201    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3596  hypothetical protein  99.37 
 
 
399 bp  615  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  85.07 
 
 
947 bp  476  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  82.05 
 
 
944 bp  333  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  82.05 
 
 
944 bp  333  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  100 
 
 
387 bp  91.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  82.81 
 
 
947 bp  79.8  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  82.81 
 
 
947 bp  79.8  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  82.81 
 
 
947 bp  79.8  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2828    82.81 
 
 
3176 bp  79.8  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  82.81 
 
 
947 bp  79.8  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  82.81 
 
 
947 bp  79.8  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  93.18 
 
 
947 bp  63.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2003  hypothetical protein  92.68 
 
 
819 bp  58  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.29 
 
 
944 bp  56  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3938    94.29 
 
 
276 bp  54  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8454  transposase and inactivated derivatives-like protein  90.48 
 
 
504 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8799    90.48 
 
 
417 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.806351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>