40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2828 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0389  transposase  100 
 
 
947 bp  1877    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  100 
 
 
947 bp  1877    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  100 
 
 
947 bp  1877    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  100 
 
 
947 bp  1877    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  100 
 
 
947 bp  1877    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2828    100 
 
 
3176 bp  6296    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0288    82.81 
 
 
606 bp  79.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  79.9 
 
 
944 bp  79.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  79.9 
 
 
944 bp  79.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3596  hypothetical protein  82.81 
 
 
399 bp  79.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  88.06 
 
 
567 bp  69.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3938    86.67 
 
 
276 bp  69.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  77.85 
 
 
947 bp  67.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  87.5 
 
 
507 bp  63.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0058    87.93 
 
 
956 bp  60  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3731    87.93 
 
 
932 bp  60  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    92.68 
 
 
567 bp  58  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  96.88 
 
 
2100 bp  56  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  85.71 
 
 
531 bp  54  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  85.71 
 
 
531 bp  54  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  85.71 
 
 
531 bp  54  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  85.71 
 
 
531 bp  54  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32330  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  92.11 
 
 
309 bp  52  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  96.55 
 
 
684 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  96.55 
 
 
642 bp  50.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>