52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_23930  transposase  98.75 
 
 		 642 bp  1203    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  98.75 
 
 		 642 bp  1203    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  98.47 
 
 		 603 bp  1086    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  98.05 
 
 		 642 bp  1120    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  98.13 
 
 		 642 bp  1172    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  97.51 
 
 		 642 bp  1140    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21750    97.57 
 
 		 3318 bp  1689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  97.51 
 
 		 642 bp  1140    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  97.51 
 
 		 642 bp  1140    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28090  transposase or inactivated derivative  98.86 
 
 		 351 bp  658    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  98.29 
 
 		 642 bp  1179    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  98.44 
 
 		 642 bp  1187    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  98.44 
 
 		 642 bp  1187    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  98.43 
 
 		 510 bp  942    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  97.51 
 
 		 441 bp  787    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  97.51 
 
 		 642 bp  1140    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29370    100 
 
 		 945 bp  1873    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35600  transposase  98.98 
 
 		 318 bp  559  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32330  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  96.44 
 
 		 309 bp  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32610  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  92.53 
 
 		 384 bp  484  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  89.47 
 
 		 567 bp  87.7  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  91.23 
 
 		 531 bp  73.8  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  91.23 
 
 		 531 bp  73.8  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  91.23 
 
 		 531 bp  73.8  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  91.23 
 
 		 531 bp  73.8  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  86.25 
 
 		 947 bp  71.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    100 
 
 		 567 bp  69.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3938    85.54 
 
 		 276 bp  69.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  88.89 
 
 		 955 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  88.89 
 
 		 955 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2127  putative transposase of insertion sequence  88.68 
 
 		 348 bp  58  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0218994  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  92.68 
 
 		 567 bp  58  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  89.58 
 
 		 381 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2333    94.12 
 
 		 943 bp  52  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  87.04 
 
 		 955 bp  52  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  87.04 
 
 		 955 bp  52  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4477  ISSpo6, transposase OrfB  87.04 
 
 		 519 bp  52  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845836  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4537  ISSpo6, transposase OrfB  87.04 
 
 		 519 bp  52  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  90.24 
 
 		 962 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0432  hypothetical protein  100 
 
 		 921 bp  50.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.672675  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  87.76 
 
 		 408 bp  50.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  87.5 
 
 		 507 bp  48.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  93.75 
 
 		 947 bp  48.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>