28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4262 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4262    100 
 
 
958 bp  1899    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  89.39 
 
 
958 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4537  ISSpo6, transposase OrfB  90.91 
 
 
519 bp  69.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4477  ISSpo6, transposase OrfB  90.91 
 
 
519 bp  69.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845836  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  90.91 
 
 
955 bp  69.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  90.91 
 
 
955 bp  69.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  89.09 
 
 
955 bp  61.9  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3285    92.86 
 
 
952 bp  60  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.930868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  92.86 
 
 
959 bp  60  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2412    92.86 
 
 
952 bp  60  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0606    92.86 
 
 
951 bp  60  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  92.68 
 
 
955 bp  58  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  86.44 
 
 
717 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  90.7 
 
 
852 bp  54  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  86.44 
 
 
717 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  86.44 
 
 
381 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  86.44 
 
 
717 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  86.44 
 
 
717 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  86.44 
 
 
717 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  86.44 
 
 
717 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  86.44 
 
 
717 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  86.44 
 
 
717 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  86.44 
 
 
717 bp  54  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8591    84.85 
 
 
568 bp  52  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2358    88.64 
 
 
1776 bp  48.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313979  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  88.64 
 
 
946 bp  48.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  88.64 
 
 
946 bp  48.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  88.64 
 
 
946 bp  48.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>