45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7908 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7908    100 
 
 
166 bp  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6302    87.35 
 
 
498 bp  163  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  88.24 
 
 
522 bp  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8591    81.9 
 
 
568 bp  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4598    88.89 
 
 
571 bp  60  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1661  transposase and inactivated derivatives-like protein  92.5 
 
 
246 bp  56  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1978    92.5 
 
 
192 bp  56  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494643  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3301  putative transposase of insertion sequence  87.5 
 
 
513 bp  56  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 
477 bp  52  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 
477 bp  52  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 
477 bp  52  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 
477 bp  52  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 
477 bp  52  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 
477 bp  52  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  84.29 
 
 
576 bp  52  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  91.89 
 
 
717 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  91.89 
 
 
717 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  91.89 
 
 
717 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  91.89 
 
 
717 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  91.89 
 
 
381 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  91.89 
 
 
717 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  91.89 
 
 
717 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  91.89 
 
 
717 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  91.89 
 
 
717 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  91.89 
 
 
717 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0058    80 
 
 
956 bp  48.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  91.43 
 
 
477 bp  46.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  91.43 
 
 
477 bp  46.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4235    89.74 
 
 
962 bp  46.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.816521  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  89.74 
 
 
962 bp  46.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3757    81.32 
 
 
936 bp  46.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  96.3 
 
 
2355 bp  46.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.985058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>