24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4598 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4598    100 
 
 		 571 bp  1132    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  91.3 
 
 		 717 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7908    88.89 
 
 		 166 bp  60  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598531  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  91.3 
 
 		 717 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  91.3 
 
 		 381 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  91.3 
 
 		 717 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  91.3 
 
 		 717 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  91.3 
 
 		 717 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  91.3 
 
 		 717 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  91.3 
 
 		 717 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  91.3 
 
 		 717 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  91.3 
 
 		 717 bp  60  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  87.72 
 
 		 958 bp  58  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  93.94 
 
 		 504 bp  50.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1978    96.55 
 
 		 192 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  93.94 
 
 		 504 bp  50.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  93.94 
 
 		 504 bp  50.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  93.94 
 
 		 504 bp  50.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  93.94 
 
 		 504 bp  50.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  93.94 
 
 		 504 bp  50.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  93.94 
 
 		 504 bp  50.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1661  transposase and inactivated derivatives-like protein  96.55 
 
 		 246 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2333    93.75 
 
 		 943 bp  48.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  100 
 
 		 2103 bp  48.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>