50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3765 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3765  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  156  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  0.890708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3846  hypothetical protein  73.17 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.294656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.49 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  86.49 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  86.49 
 
 
492 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  71.43 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  71.43 
 
 
125 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  71.43 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  71.43 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  80.56 
 
 
320 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  63.89 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  61.11 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  58.33 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  55.56 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  59.46 
 
 
315 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  59.46 
 
 
314 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  59.46 
 
 
315 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  59.46 
 
 
315 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  59.46 
 
 
315 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  75 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  59.38 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  55.56 
 
 
315 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  58.33 
 
 
136 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  58.33 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  60.61 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  60.61 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  58.33 
 
 
315 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  52.78 
 
 
314 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  52.78 
 
 
314 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3056  putative transposase  45.95 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.558452  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2855  putative transposase  45.95 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2299  putative transposase  45.95 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1694  putative transposase  43.59 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0919099  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1282  putative transposase  45.95 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  56.76 
 
 
315 aa  40  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  56.76 
 
 
315 aa  40  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  56.76 
 
 
315 aa  40  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  56.76 
 
 
315 aa  40  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  56.76 
 
 
315 aa  40  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>