26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4238 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4238    100 
 
 		 177 bp  351  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  84.13 
 
 		 567 bp  91.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  89.02 
 
 		 947 bp  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.76 
 
 		 944 bp  91.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    87.5 
 
 		 567 bp  79.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  86.25 
 
 		 567 bp  71.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  86.15 
 
 		 717 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  87.72 
 
 		 507 bp  58  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  86.15 
 
 		 717 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  86.15 
 
 		 717 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  86.15 
 
 		 381 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  86.15 
 
 		 717 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  86.15 
 
 		 717 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  86.15 
 
 		 717 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  86.15 
 
 		 717 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  86.15 
 
 		 717 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  86.15 
 
 		 717 bp  58  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1960    81.25 
 
 		 351 bp  56  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  92.11 
 
 		 947 bp  52  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1653 bp  46.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  89.74 
 
 		 947 bp  46.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  89.74 
 
 		 947 bp  46.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2828    89.74 
 
 		 3176 bp  46.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  89.74 
 
 		 947 bp  46.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  89.74 
 
 		 947 bp  46.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  89.74 
 
 		 947 bp  46.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>