127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1270 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
301 aa  617  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  55.39 
 
 
503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  52.16 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  58.85 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  50.38 
 
 
286 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  50.71 
 
 
286 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  58.58 
 
 
238 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  47.45 
 
 
330 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  44.53 
 
 
469 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.24 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  43.4 
 
 
694 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  41.36 
 
 
291 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  42.76 
 
 
279 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  44.66 
 
 
642 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  44.66 
 
 
641 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  44.58 
 
 
556 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  43.03 
 
 
281 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.12 
 
 
532 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  43.31 
 
 
1290 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  40.75 
 
 
1321 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  42.42 
 
 
289 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.85 
 
 
912 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.46 
 
 
884 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  38.57 
 
 
389 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.63 
 
 
252 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  43.85 
 
 
383 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.4 
 
 
627 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  39.29 
 
 
423 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  39.57 
 
 
1918 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  40.73 
 
 
283 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.87 
 
 
328 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  39.15 
 
 
883 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.27 
 
 
633 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.91 
 
 
306 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.5 
 
 
315 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.62 
 
 
288 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 
291 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.13 
 
 
1694 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.53 
 
 
282 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  38.11 
 
 
286 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  36.82 
 
 
275 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.36 
 
 
1059 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.63 
 
 
742 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.05 
 
 
547 aa  148  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35.22 
 
 
426 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  35.74 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  36.86 
 
 
409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  36.96 
 
 
313 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  37.8 
 
 
569 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  37.25 
 
 
1028 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  39.93 
 
 
1441 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.21 
 
 
290 aa  142  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.26 
 
 
819 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  36.96 
 
 
588 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.29 
 
 
261 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  32.86 
 
 
405 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 
1332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  31.14 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  33.92 
 
 
384 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 
752 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  35.16 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  32.44 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  30.8 
 
 
427 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  36.19 
 
 
260 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  32.67 
 
 
320 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  32 
 
 
263 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  31.99 
 
 
394 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  32.01 
 
 
479 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  35.91 
 
 
907 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  31.35 
 
 
346 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 
608 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  37.1 
 
 
467 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  32.36 
 
 
479 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  31.65 
 
 
269 aa  95.5  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 
465 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 
449 aa  92  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  31.82 
 
 
470 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  30.18 
 
 
539 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  31.12 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  30.16 
 
 
464 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  29.41 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.84 
 
 
475 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  30.27 
 
 
446 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  26.61 
 
 
1707 aa  86.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.42 
 
 
722 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  36.42 
 
 
295 aa  85.5  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  30.13 
 
 
477 aa  85.5  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  28.67 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.24 
 
 
915 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  30.31 
 
 
686 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.75 
 
 
1007 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  32.22 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.11 
 
 
639 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  27.99 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  26.91 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  28.43 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  29.74 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  27.36 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  27.67 
 
 
842 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>