More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3467 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  85.33 
 
 		 230 aa  358  5e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  81.86 
 
 		 229 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  81.86 
 
 		 229 aa  341  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  81.86 
 
 		 229 aa  341  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  79.44 
 
 		 229 aa  322  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.03 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  46.3 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  35.38 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  22.82 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  19.39 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  20.48 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  37.74 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.07 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 445 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>