More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2175 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  59.41 
 
 		 1194 aa  1233    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  49.38 
 
 		 1213 aa  888    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  39.67 
 
 		 1172 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  51.74 
 
 		 1191 aa  959    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  51.4 
 
 		 1203 aa  932    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  83.95 
 
 		 1195 aa  1755    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  52.04 
 
 		 1183 aa  944    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  50.87 
 
 		 1191 aa  914    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  59.75 
 
 		 1199 aa  1213    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  84.2 
 
 		 1195 aa  1759    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  66.11 
 
 		 1194 aa  1393    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  66.19 
 
 		 1217 aa  1379    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  49.56 
 
 		 1222 aa  936    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1194 aa  2336    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  56.24 
 
 		 1198 aa  1083    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  39.9 
 
 		 1225 aa  697    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  51.46 
 
 		 1195 aa  954    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  92.38 
 
 		 1194 aa  1993    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  48.39 
 
 		 1217 aa  895    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  52.48 
 
 		 1224 aa  1072    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  84.2 
 
 		 1195 aa  1759    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  56.82 
 
 		 1188 aa  930    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  57.55 
 
 		 1214 aa  1101    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.83 
 
 		 1198 aa  1085    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  52.97 
 
 		 1186 aa  917    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  54.15 
 
 		 1191 aa  1080    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  50.29 
 
 		 1222 aa  934    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  50.46 
 
 		 1181 aa  885    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  75.86 
 
 		 1205 aa  1616    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  52.57 
 
 		 1188 aa  939    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  52.45 
 
 		 1188 aa  1041    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  51.61 
 
 		 1227 aa  533  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.9 
 
 		 1190 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  33.07 
 
 		 1187 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.03 
 
 		 1176 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.73 
 
 		 1176 aa  466  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.74 
 
 		 1196 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.25 
 
 		 1175 aa  459  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 		 1176 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.55 
 
 		 1176 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1189 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.43 
 
 		 1186 aa  449  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.1 
 
 		 1185 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.74 
 
 		 1188 aa  445  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.74 
 
 		 1188 aa  445  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  48.26 
 
 		 1263 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.3 
 
 		 1185 aa  430  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.63 
 
 		 1174 aa  429  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  63.95 
 
 		 1218 aa  426  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  67.41 
 
 		 1234 aa  426  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.54 
 
 		 1199 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 		 1199 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.59 
 
 		 1199 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.16 
 
 		 1186 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  31.68 
 
 		 1198 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 		 1185 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 		 1179 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.18 
 
 		 1177 aa  386  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.23 
 
 		 1168 aa  363  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 		 1167 aa  360  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1164 aa  348  5e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.04 
 
 		 1170 aa  346  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 		 1181 aa  343  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  32.11 
 
 		 1190 aa  343  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.35 
 
 		 1164 aa  332  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  28.39 
 
 		 1141 aa  332  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  28.45 
 
 		 1172 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.01 
 
 		 1187 aa  319  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.42 
 
 		 1153 aa  318  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  30.55 
 
 		 1154 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.76 
 
 		 1185 aa  306  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.93 
 
 		 1174 aa  306  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 		 1186 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  35.11 
 
 		 1174 aa  302  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1184 aa  300  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.31 
 
 		 1198 aa  298  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.22 
 
 		 1189 aa  293  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.47 
 
 		 1189 aa  291  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  34.19 
 
 		 1301 aa  287  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.59 
 
 		 1308 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 		 1191 aa  283  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.85 
 
 		 1184 aa  280  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 		 1177 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  26.03 
 
 		 1175 aa  275  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.69 
 
 		 1179 aa  273  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  23.37 
 
 		 1191 aa  271  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.49 
 
 		 1178 aa  265  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  52.91 
 
 		 1185 aa  258  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  41.64 
 
 		 1190 aa  255  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  25.64 
 
 		 1149 aa  255  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.8 
 
 		 1172 aa  253  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.28 
 
 		 1175 aa  253  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  55.4 
 
 		 1189 aa  251  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  55.4 
 
 		 1189 aa  251  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  55.4 
 
 		 1189 aa  251  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  54.93 
 
 		 1189 aa  251  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  54.93 
 
 		 1189 aa  251  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  54.93 
 
 		 1189 aa  251  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  54.93 
 
 		 1189 aa  251  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  54.93 
 
 		 1189 aa  251  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>