283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0988 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  61 
 
 		 519 aa  680    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  62.16 
 
 		 520 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  62.55 
 
 		 520 aa  688    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  62.16 
 
 		 520 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 528 aa  1079    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  60.96 
 
 		 520 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  57.58 
 
 		 536 aa  624  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 537 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 539 aa  176  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 536 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 537 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 559 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.86 
 
 		 533 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 549 aa  163  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.44 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.17 
 
 		 530 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.47 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 554 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 531 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 533 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 516 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  28.86 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 536 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 534 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 564 aa  145  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 565 aa  143  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 556 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  29.35 
 
 		 532 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  25.98 
 
 		 556 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  29.16 
 
 		 532 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 532 aa  130  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 510 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 563 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  25.95 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.62 
 
 		 510 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 514 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 517 aa  110  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 527 aa  106  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 530 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 530 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 533 aa  97.8  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  24.95 
 
 		 548 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  25.41 
 
 		 535 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 551 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  23.8 
 
 		 506 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 505 aa  87  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.12 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 545 aa  84  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  25.41 
 
 		 529 aa  84  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  22.57 
 
 		 512 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  25.77 
 
 		 545 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 526 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  22.39 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  23.85 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.27 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.95 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  22.66 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  24.2 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  23.4 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  26.87 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  23.9 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  21.4 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  29.56 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  21.53 
 
 		 520 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24.5 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  23.17 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>