131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1867 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 541 aa  1105    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  45.92 
 
 		 550 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 537 aa  207  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  30.47 
 
 		 537 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  28.14 
 
 		 634 aa  160  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  27.64 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  25.89 
 
 		 574 aa  145  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  27.53 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  27.01 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.83 
 
 		 781 aa  113  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  24.66 
 
 		 781 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  24.78 
 
 		 798 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  23.27 
 
 		 774 aa  98.2  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  23.82 
 
 		 791 aa  97.8  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  24.61 
 
 		 798 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  25.21 
 
 		 807 aa  90.9  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.05 
 
 		 785 aa  90.9  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  23.91 
 
 		 852 aa  90.9  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.21 
 
 		 723 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  21.96 
 
 		 772 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.36 
 
 		 669 aa  86.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  20.92 
 
 		 670 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.46 
 
 		 722 aa  85.1  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  23.52 
 
 		 797 aa  84  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  22.93 
 
 		 754 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.44 
 
 		 654 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  23.52 
 
 		 785 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.87 
 
 		 619 aa  82  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  22.83 
 
 		 754 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  23.45 
 
 		 739 aa  80.1  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  23.13 
 
 		 798 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  22.77 
 
 		 790 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  22.86 
 
 		 758 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  22.08 
 
 		 788 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  22.71 
 
 		 756 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  22.32 
 
 		 762 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  22.68 
 
 		 758 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  23.42 
 
 		 835 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  22.09 
 
 		 753 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  21.11 
 
 		 779 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  22.09 
 
 		 753 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.14 
 
 		 712 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  21.96 
 
 		 753 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.87 
 
 		 676 aa  74.3  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  22.34 
 
 		 761 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  21.31 
 
 		 801 aa  73.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  26.61 
 
 		 938 aa  70.1  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  20.08 
 
 		 1067 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  20.95 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  22.91 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  23.49 
 
 		 777 aa  68.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  20.82 
 
 		 775 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  22.11 
 
 		 766 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  22.58 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  20.89 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.79 
 
 		 773 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  28.29 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  21.98 
 
 		 745 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  35.92 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.79 
 
 		 723 aa  60.1  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  25.52 
 
 		 749 aa  60.5  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.09 
 
 		 934 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.09 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.09 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.09 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.09 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  25.1 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.09 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  21.71 
 
 		 766 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  21.71 
 
 		 766 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  23.65 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.34 
 
 		 929 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  21.36 
 
 		 746 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  24.79 
 
 		 793 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  21.36 
 
 		 755 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 934 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  26.03 
 
 		 874 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  21.36 
 
 		 755 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  27.18 
 
 		 838 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 934 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  31.97 
 
 		 849 aa  54.3  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  21.65 
 
 		 766 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  23.46 
 
 		 791 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.54 
 
 		 934 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  22.06 
 
 		 766 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.54 
 
 		 934 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  21.62 
 
 		 766 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  21.62 
 
 		 766 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  24.58 
 
 		 790 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  23.36 
 
 		 787 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  22.5 
 
 		 799 aa  50.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  26.21 
 
 		 782 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  22.39 
 
 		 757 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  24.83 
 
 		 614 aa  50.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  25.27 
 
 		 841 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  36.56 
 
 		 646 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.02 
 
 		 921 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  36.56 
 
 		 644 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>