More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2832 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  96.7 
 
 		 575 aa  957    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 575 aa  1112    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  81.42 
 
 		 569 aa  832    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.94 
 
 		 583 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.57 
 
 		 579 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.49 
 
 		 579 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.02 
 
 		 579 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  56.81 
 
 		 581 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  55.38 
 
 		 583 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.5 
 
 		 573 aa  538  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.51 
 
 		 575 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  55.73 
 
 		 564 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  48.01 
 
 		 544 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.63 
 
 		 573 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.37 
 
 		 575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  37.65 
 
 		 563 aa  273  8.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  38.42 
 
 		 372 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  37.24 
 
 		 370 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  37.24 
 
 		 370 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  38.08 
 
 		 370 aa  183  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.97 
 
 		 371 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  38.07 
 
 		 369 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  38.48 
 
 		 377 aa  180  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  35.77 
 
 		 368 aa  178  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  36.55 
 
 		 366 aa  174  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  38.59 
 
 		 372 aa  163  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  34.42 
 
 		 340 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 551 aa  83.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  41.13 
 
 		 184 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  36.62 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  25.47 
 
 		 514 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  40.58 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.01 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  27.96 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  27.47 
 
 		 356 aa  67  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  25.26 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.86 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  45.28 
 
 		 187 aa  62  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  45.28 
 
 		 187 aa  62  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  30.41 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.83 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  23.4 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  24.27 
 
 		 365 aa  57  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  23.84 
 
 		 354 aa  57  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  24 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  31.79 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.47 
 
 		 381 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  24 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  25.46 
 
 		 553 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  31.61 
 
 		 518 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  25.72 
 
 		 374 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  24.56 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  32.2 
 
 		 424 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 526 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 364 aa  54.3  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  23.44 
 
 		 354 aa  53.9  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 		 627 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31030  putative cation efflux system protein  30.48 
 
 		 409 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000427913  unclonable  4.33311e-22 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.32 
 
 		 404 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.11 
 
 		 352 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 373 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  22.51 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 553 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 371 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  28.06 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2160  secretion protein HlyD  26.07 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.36 
 
 		 355 aa  52.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  31.12 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4376  RND family efflux transporter MFP subunit  23.21 
 
 		 370 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.349604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.39 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 		 404 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  24.43 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 		 568 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  24.43 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  30.04 
 
 		 396 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.01 
 
 		 346 aa  52  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 411 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 		 358 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2987  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 368 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.331807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  26.29 
 
 		 504 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  27.16 
 
 		 356 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 		 456 aa  51.6  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1144  hypothetical protein  39.05 
 
 		 183 aa  51.2  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  31.96 
 
 		 398 aa  51.2  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  23.13 
 
 		 353 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 		 358 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>