241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0416 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  696    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  55.31 
 
 		 752 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  58.12 
 
 		 676 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  54.63 
 
 		 831 aa  327  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  54.14 
 
 		 930 aa  321  9.000000000000001e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  57.1 
 
 		 668 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  51.14 
 
 		 579 aa  308  9e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  47.3 
 
 		 627 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  51.72 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  50.51 
 
 		 709 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  50 
 
 		 930 aa  279  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  52.63 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  51.86 
 
 		 522 aa  275  9e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  49.51 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  51.48 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  49.47 
 
 		 1293 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  43.97 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  45.32 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  40.91 
 
 		 588 aa  228  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  36.57 
 
 		 1146 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1163 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.88 
 
 		 786 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  35.08 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  36.64 
 
 		 1140 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  34.38 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  33.45 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  36.58 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  34.72 
 
 		 1079 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  32.08 
 
 		 1750 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  36.95 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  34.44 
 
 		 1351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  37.19 
 
 		 1030 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  38.97 
 
 		 2296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  37.89 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  33.44 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 		 850 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  34.07 
 
 		 963 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  37.04 
 
 		 646 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1068 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  34.04 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1051 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.07 
 
 		 1030 aa  136  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  39.86 
 
 		 447 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  34.34 
 
 		 1177 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  34.63 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.94 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.83 
 
 		 1130 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  34.52 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  34.94 
 
 		 1026 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  30.12 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  33.93 
 
 		 347 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  35.59 
 
 		 664 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  30.8 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  30.51 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  30.51 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  32.03 
 
 		 888 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.17 
 
 		 1292 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  30.5 
 
 		 903 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  30.16 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  31.3 
 
 		 359 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  34.19 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.86 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 898 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  33.44 
 
 		 1763 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  30.77 
 
 		 913 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.41 
 
 		 693 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.38 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  31.25 
 
 		 700 aa  113  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.67 
 
 		 899 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  31.91 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  32.03 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.85 
 
 		 841 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  31.86 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  30.58 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  31.98 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  30.95 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  31.12 
 
 		 379 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  30.47 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  28.96 
 
 		 906 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.99 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  31.16 
 
 		 937 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  32.35 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  31.53 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  29.66 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  33.22 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  30.77 
 
 		 711 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  28.34 
 
 		 284 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 		 892 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  29.11 
 
 		 364 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.6 
 
 		 639 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 		 732 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  27.02 
 
 		 2831 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  28.93 
 
 		 448 aa  94.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 		 772 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  29.22 
 
 		 279 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  26.3 
 
 		 1046 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1834 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>