More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3437 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  100 
 
 
955 aa  1789    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.73 
 
 
1146 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  34.86 
 
 
758 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.62 
 
 
981 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  36.78 
 
 
1339 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  35.31 
 
 
963 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.77 
 
 
1151 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 
905 aa  114  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 
1015 aa  104  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 
953 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.94 
 
 
1118 aa  95.1  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.14 
 
 
1797 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  20.38 
 
 
2279 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.36 
 
 
1006 aa  84.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.39 
 
 
1663 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.25 
 
 
916 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.99 
 
 
2017 aa  82  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  26.79 
 
 
786 aa  82  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  43.89 
 
 
932 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.95 
 
 
1150 aa  80.1  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.39 
 
 
1901 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  20.73 
 
 
1794 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  26.67 
 
 
1885 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  29.23 
 
 
723 aa  77.8  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.97 
 
 
1795 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
1321 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  28.61 
 
 
974 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.61 
 
 
1029 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 
954 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 
1403 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  26.12 
 
 
1668 aa  77  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.11 
 
 
1105 aa  76.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  28.53 
 
 
1050 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.53 
 
 
1050 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  20.31 
 
 
2272 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  31.37 
 
 
1071 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.85 
 
 
1908 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  20.09 
 
 
2303 aa  74.7  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  20.2 
 
 
1805 aa  74.7  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.79 
 
 
1804 aa  74.7  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  31.66 
 
 
923 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 
901 aa  73.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.56 
 
 
1121 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  22.51 
 
 
1057 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  26.6 
 
 
1837 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 
959 aa  72.4  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 
965 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.82 
 
 
1055 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  29.43 
 
 
940 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.33 
 
 
1141 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.33 
 
 
1141 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.46 
 
 
1175 aa  70.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  29.01 
 
 
1114 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  24.32 
 
 
1836 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  30.82 
 
 
855 aa  69.3  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.08 
 
 
1122 aa  69.3  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.3 
 
 
1123 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  28.35 
 
 
1148 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  30.88 
 
 
922 aa  69.3  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 
947 aa  68.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.7 
 
 
1013 aa  68.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
1085 aa  68.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.77 
 
 
998 aa  68.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  27.89 
 
 
1090 aa  68.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  30.04 
 
 
1043 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  30.42 
 
 
872 aa  67.8  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.29 
 
 
1141 aa  68.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.24 
 
 
1468 aa  67.8  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  30.04 
 
 
967 aa  67.4  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
1065 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.47 
 
 
1089 aa  67.4  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.26 
 
 
1845 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 
900 aa  67  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  31.05 
 
 
1053 aa  67  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  28.4 
 
 
914 aa  66.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  30 
 
 
1132 aa  66.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  46.24 
 
 
1085 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 
911 aa  66.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
1137 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  29.56 
 
 
964 aa  65.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  32.47 
 
 
925 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.5 
 
 
1054 aa  65.1  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  29.33 
 
 
1143 aa  65.1  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 
928 aa  65.1  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  29.08 
 
 
900 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.98 
 
 
1081 aa  65.1  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.9 
 
 
1080 aa  64.7  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  28.27 
 
 
1141 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  29.91 
 
 
929 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.76 
 
 
1067 aa  64.3  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.22 
 
 
1685 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  29.66 
 
 
1036 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  24.48 
 
 
1809 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.79 
 
 
1053 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
882 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.2 
 
 
967 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  27.85 
 
 
1022 aa  63.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  28.29 
 
 
921 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 
1400 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>