272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0324 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  100 
 
 
694 aa  1398    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  58.01 
 
 
506 aa  584  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  52.75 
 
 
846 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.62 
 
 
701 aa  140  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  32.49 
 
 
577 aa  126  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  43.96 
 
 
609 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  31.14 
 
 
591 aa  124  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
812 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.49 
 
 
506 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.46 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.96 
 
 
506 aa  110  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.99 
 
 
469 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  32.76 
 
 
815 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  30.45 
 
 
342 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 
728 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  42.31 
 
 
942 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.79 
 
 
584 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  48.08 
 
 
628 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.24 
 
 
532 aa  97.4  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
590 aa  97.4  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  46.85 
 
 
1128 aa  97.1  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.09 
 
 
417 aa  96.3  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.67 
 
 
857 aa  95.5  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 
854 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  49.04 
 
 
596 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  50 
 
 
446 aa  92.8  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  50.96 
 
 
774 aa  91.7  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  45.19 
 
 
719 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  49.06 
 
 
842 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  40.31 
 
 
486 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  49.47 
 
 
366 aa  88.6  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  44.83 
 
 
847 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  41.07 
 
 
773 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.63 
 
 
984 aa  88.6  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  49.04 
 
 
743 aa  87.8  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  26.92 
 
 
583 aa  88.2  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  46.23 
 
 
633 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  43.86 
 
 
488 aa  87  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.08 
 
 
588 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  45.63 
 
 
393 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.25 
 
 
499 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  42.16 
 
 
778 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.86 
 
 
590 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  48.31 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  43.27 
 
 
489 aa  84.7  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  46.08 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  47.66 
 
 
756 aa  84  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.66 
 
 
469 aa  84  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  43.81 
 
 
623 aa  84  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  42.72 
 
 
925 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  43.81 
 
 
842 aa  83.2  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  44.34 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  35.22 
 
 
727 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  48.31 
 
 
422 aa  82  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  40 
 
 
580 aa  82  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  37.14 
 
 
688 aa  81.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.86 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  39.09 
 
 
746 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  30.34 
 
 
699 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.48 
 
 
479 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  40.74 
 
 
495 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  39.45 
 
 
423 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  33.53 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  43.14 
 
 
681 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  42.31 
 
 
744 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  41.88 
 
 
963 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  53.75 
 
 
460 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  41.9 
 
 
906 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  36.17 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  40.78 
 
 
934 aa  77.8  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  43.24 
 
 
1042 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  41.94 
 
 
681 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  41.9 
 
 
605 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  40.2 
 
 
442 aa  76.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  40 
 
 
455 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  46.59 
 
 
1055 aa  76.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  40.2 
 
 
974 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  40.78 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  36.75 
 
 
533 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  40.2 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  34.71 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 
966 aa  74.7  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.38 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  45.78 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.16 
 
 
998 aa  74.3  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  41.75 
 
 
775 aa  73.9  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.35 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  36.75 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  44.23 
 
 
829 aa  73.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.02 
 
 
448 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  38.18 
 
 
864 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  43.88 
 
 
467 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  40.2 
 
 
894 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  37.27 
 
 
669 aa  72.4  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  45.88 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.79 
 
 
633 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  35.25 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>