More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3494 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  49.92 
 
 		 1175 aa  1046    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  39.64 
 
 		 1198 aa  682    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  50.93 
 
 		 1176 aa  1041    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  42.7 
 
 		 1173 aa  821    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  50.25 
 
 		 1176 aa  1053    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  40.05 
 
 		 1199 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  40.39 
 
 		 1199 aa  703    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1177 aa  2361    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  49.42 
 
 		 1176 aa  1054    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  50.54 
 
 		 1176 aa  1060    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  40.39 
 
 		 1199 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  55.92 
 
 		 1176 aa  1174    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  34.34 
 
 		 1187 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  35.03 
 
 		 1204 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  33.06 
 
 		 1190 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.2 
 
 		 1187 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.91 
 
 		 1196 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.9 
 
 		 1198 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  33.04 
 
 		 1189 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.04 
 
 		 1189 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  33.02 
 
 		 1189 aa  544  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  34.97 
 
 		 1403 aa  542  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  33.98 
 
 		 1189 aa  539  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  33.85 
 
 		 1189 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  33.47 
 
 		 1189 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  33.69 
 
 		 1189 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  33.47 
 
 		 1189 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1185 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1191 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 		 1167 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  32.28 
 
 		 1167 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  34.04 
 
 		 1168 aa  497  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  30.24 
 
 		 1178 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  30.56 
 
 		 1169 aa  490  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  34.23 
 
 		 1162 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  33.42 
 
 		 1162 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  34.13 
 
 		 1162 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  34.01 
 
 		 1162 aa  489  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  30.65 
 
 		 1169 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  33.52 
 
 		 1162 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  33.58 
 
 		 1162 aa  486  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  31.14 
 
 		 1176 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.99 
 
 		 1188 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  32.26 
 
 		 1167 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  32.42 
 
 		 1167 aa  480  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.99 
 
 		 1188 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  32.12 
 
 		 1177 aa  478  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  31.46 
 
 		 1171 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.43 
 
 		 1177 aa  476  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 		 1171 aa  469  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  31.98 
 
 		 1255 aa  464  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 		 1179 aa  462  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 		 1178 aa  457  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.46 
 
 		 1186 aa  458  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 		 1173 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  32.19 
 
 		 1172 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1190 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  31.24 
 
 		 1184 aa  447  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  31.93 
 
 		 1170 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  32.01 
 
 		 1170 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 		 1198 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  30.35 
 
 		 1171 aa  446  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  32.01 
 
 		 1170 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  31.85 
 
 		 1200 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  31.85 
 
 		 1268 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  32.01 
 
 		 1170 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  31.85 
 
 		 1202 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  31.85 
 
 		 1170 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  32 
 
 		 1198 aa  440  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  32.18 
 
 		 1182 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  32.09 
 
 		 1175 aa  439  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  33 
 
 		 1152 aa  436  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  32.43 
 
 		 1171 aa  436  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  32.41 
 
 		 1181 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  31.64 
 
 		 1175 aa  432  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  32.02 
 
 		 1175 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.74 
 
 		 1179 aa  422  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 		 1174 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1174 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  31.83 
 
 		 1171 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  29.86 
 
 		 1308 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.22 
 
 		 1177 aa  403  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  32.07 
 
 		 1109 aa  399  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 		 1181 aa  400  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  27.35 
 
 		 1180 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 		 1164 aa  364  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 		 1170 aa  357  5.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.94 
 
 		 1174 aa  356  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33 
 
 		 1185 aa  320  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 		 1301 aa  319  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.66 
 
 		 1186 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.9 
 
 		 1153 aa  314  4.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.71 
 
 		 1189 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  31.61 
 
 		 1189 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.71 
 
 		 1189 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  31.59 
 
 		 1174 aa  282  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  33.07 
 
 		 1165 aa  281  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  31.35 
 
 		 1168 aa  278  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  24.25 
 
 		 1184 aa  273  9e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.06 
 
 		 1189 aa  273  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>