116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0691 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  43.79 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  37.02 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  37.89 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  35.85 
 
 		 181 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 173 aa  89  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  31.68 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  34.03 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  22.1 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 383 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  30.51 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  29.33 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>