More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2190 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  26.78 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  28.1 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.78 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  27.21 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  35.64 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  26.74 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.68 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  30.33 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>