More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1888 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  42.08 
 
 		 1098 aa  770    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  40.39 
 
 		 1010 aa  733    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  37.36 
 
 		 1041 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1153 aa  2377    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 		 1129 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  35.92 
 
 		 1063 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 1008 aa  563  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 1059 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1127 aa  546  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1031 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  33.55 
 
 		 1028 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 1093 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  32.45 
 
 		 1071 aa  456  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 1105 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1063 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1147 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1135 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1153 aa  433  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1142 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  31.2 
 
 		 1065 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1059 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1165 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1074 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 1166 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1059 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1038 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1081 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1040 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1022 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1138 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1038 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  29.9 
 
 		 1058 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1169 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1065 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 962 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1043 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1081 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1073 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1137 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1051 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1073 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1189 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 1050 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1067 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1036 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1102 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1115 aa  367  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1087 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1068 aa  364  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1071 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 1234 aa  360  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1011 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1043 aa  357  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1098 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1033 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1163 aa  350  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1064 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1078 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1033 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.83 
 
 		 1051 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1047 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  28.99 
 
 		 1083 aa  340  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  27.78 
 
 		 1032 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1138 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1176 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1027 aa  334  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1088 aa  333  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1081 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1107 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1186 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1072 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 1039 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1099 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1071 aa  313  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.02 
 
 		 1025 aa  301  6e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1044 aa  290  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1088 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1124 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1128 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1116 aa  258  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1084 aa  257  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1109 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1023 aa  241  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 1140 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1154 aa  239  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1057 aa  239  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 1037 aa  238  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1040 aa  235  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1132 aa  234  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1097 aa  234  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 1029 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1028 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1046 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1152 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1027 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1010 aa  221  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1101 aa  221  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1079 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1043 aa  218  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1163 aa  217  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>