189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3388 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  100 
 
 		 1694 aa  3473    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 1321 aa  338  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  31.18 
 
 		 883 aa  319  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  42.62 
 
 		 328 aa  225  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.5 
 
 		 532 aa  201  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  39.17 
 
 		 694 aa  198  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.4 
 
 		 358 aa  192  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.51 
 
 		 627 aa  189  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.22 
 
 		 1290 aa  188  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  33.41 
 
 		 642 aa  185  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.08 
 
 		 328 aa  184  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  33.26 
 
 		 641 aa  184  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.46 
 
 		 912 aa  182  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.89 
 
 		 884 aa  181  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  40.59 
 
 		 276 aa  173  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.33 
 
 		 315 aa  170  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  38.35 
 
 		 281 aa  168  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36.07 
 
 		 503 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  38.29 
 
 		 291 aa  166  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  37.54 
 
 		 291 aa  165  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 1332 aa  165  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.03 
 
 		 742 aa  165  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  39.18 
 
 		 279 aa  164  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  34.07 
 
 		 1918 aa  162  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.88 
 
 		 633 aa  161  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  37.08 
 
 		 1028 aa  160  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  39.85 
 
 		 274 aa  156  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  37.13 
 
 		 301 aa  155  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.41 
 
 		 288 aa  155  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  36.11 
 
 		 423 aa  155  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  38.95 
 
 		 409 aa  154  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.15 
 
 		 282 aa  154  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  38.06 
 
 		 383 aa  153  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.1 
 
 		 1059 aa  151  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.11 
 
 		 306 aa  150  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  36.6 
 
 		 556 aa  150  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  38.18 
 
 		 283 aa  150  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  34.76 
 
 		 286 aa  146  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.5 
 
 		 252 aa  144  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  35.93 
 
 		 389 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  37.08 
 
 		 289 aa  143  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  38.21 
 
 		 286 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  37.17 
 
 		 426 aa  142  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 469 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.97 
 
 		 819 aa  131  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  34.02 
 
 		 330 aa  128  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  31.93 
 
 		 384 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.44 
 
 		 569 aa  126  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.08 
 
 		 547 aa  118  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  31.35 
 
 		 405 aa  116  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  34.75 
 
 		 588 aa  115  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.72 
 
 		 261 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.95 
 
 		 752 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  32.99 
 
 		 1441 aa  107  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  32.26 
 
 		 286 aa  105  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  31.58 
 
 		 479 aa  102  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  32.83 
 
 		 271 aa  100  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  31.05 
 
 		 313 aa  100  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 		 427 aa  100  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 394 aa  99.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  29.7 
 
 		 318 aa  99  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  28.53 
 
 		 1707 aa  97.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  31.03 
 
 		 470 aa  96.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  31.23 
 
 		 479 aa  94.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  29.31 
 
 		 477 aa  94  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  29.66 
 
 		 306 aa  94.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.02 
 
 		 290 aa  94.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 465 aa  93.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  31.12 
 
 		 467 aa  93.2  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  29.13 
 
 		 334 aa  92.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.34 
 
 		 475 aa  91.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  32.12 
 
 		 275 aa  90.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  30.25 
 
 		 238 aa  90.5  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  29.9 
 
 		 320 aa  89.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 260 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  30.34 
 
 		 464 aa  84.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  29.27 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25 
 
 		 927 aa  82  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 608 aa  80.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 449 aa  78.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  28.32 
 
 		 446 aa  78.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 277 aa  77.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  25.72 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  28.82 
 
 		 842 aa  76.3  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  28.95 
 
 		 287 aa  74.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.07 
 
 		 915 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.43 
 
 		 639 aa  73.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 		 284 aa  72  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 		 308 aa  72  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.5 
 
 		 722 aa  71.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  27.06 
 
 		 319 aa  71.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  26.97 
 
 		 263 aa  71.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  27.36 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  44.09 
 
 		 487 aa  68.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.68 
 
 		 1007 aa  68.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  28.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  26.34 
 
 		 295 aa  67.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  53.57 
 
 		 830 aa  66.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>