194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1238 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1122 aa  2301    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  83.09 
 
 		 604 aa  352  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  65.42 
 
 		 1015 aa  312  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  68.45 
 
 		 746 aa  292  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  66.36 
 
 		 541 aa  291  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  62.16 
 
 		 536 aa  289  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  62.22 
 
 		 780 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  67.15 
 
 		 1164 aa  275  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  65.17 
 
 		 629 aa  256  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  54.93 
 
 		 965 aa  245  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  42.5 
 
 		 928 aa  242  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  61.62 
 
 		 490 aa  241  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  61.26 
 
 		 951 aa  230  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  52.91 
 
 		 501 aa  228  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  53.03 
 
 		 524 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  52.06 
 
 		 509 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  53.27 
 
 		 535 aa  197  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  44.14 
 
 		 533 aa  187  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  46.04 
 
 		 679 aa  174  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  41.07 
 
 		 837 aa  171  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  42.92 
 
 		 683 aa  167  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  45 
 
 		 912 aa  158  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  40.83 
 
 		 630 aa  153  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  24.69 
 
 		 801 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  48.8 
 
 		 464 aa  128  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  46.76 
 
 		 618 aa  128  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  25.55 
 
 		 803 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  24.72 
 
 		 801 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  40.54 
 
 		 1290 aa  112  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  47.73 
 
 		 470 aa  112  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 		 566 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  48.51 
 
 		 469 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  42.54 
 
 		 479 aa  109  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  44.7 
 
 		 479 aa  102  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.4 
 
 		 945 aa  90.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  40.8 
 
 		 1186 aa  85.9  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.9 
 
 		 953 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  35.11 
 
 		 630 aa  79.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  34.64 
 
 		 1132 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  36.36 
 
 		 464 aa  77.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.11 
 
 		 982 aa  75.1  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.88 
 
 		 988 aa  74.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  46.34 
 
 		 391 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  36.72 
 
 		 1444 aa  73.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  48 
 
 		 383 aa  72  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  29.38 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  33.14 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  30.5 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  38.17 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 536 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.86 
 
 		 469 aa  67  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  57.14 
 
 		 583 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.62 
 
 		 411 aa  67.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  31.93 
 
 		 801 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  35.29 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  46.03 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.79 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  31.79 
 
 		 863 aa  65.1  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  33.58 
 
 		 884 aa  65.1  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  49.21 
 
 		 873 aa  64.7  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  42.42 
 
 		 707 aa  63.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  42.25 
 
 		 295 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.06 
 
 		 511 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  47.22 
 
 		 584 aa  63.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  31.97 
 
 		 673 aa  63.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.66 
 
 		 1338 aa  62.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  52.46 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  29.7 
 
 		 610 aa  62  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  42.86 
 
 		 600 aa  62  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  33.87 
 
 		 1391 aa  62  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  35.54 
 
 		 877 aa  61.6  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  34.09 
 
 		 957 aa  61.6  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  46.48 
 
 		 949 aa  61.6  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  44.44 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  45.16 
 
 		 955 aa  61.2  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.95 
 
 		 712 aa  61.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  54.39 
 
 		 757 aa  60.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.46 
 
 		 710 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  30.06 
 
 		 667 aa  60.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  30.09 
 
 		 918 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  48.39 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  42.86 
 
 		 621 aa  60.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 1505 aa  59.7  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  34.92 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  44.12 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  52.73 
 
 		 722 aa  58.9  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  51.67 
 
 		 885 aa  58.9  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 		 961 aa  58.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  50.85 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  40.32 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1167 aa  58.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  30.63 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  45.45 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  44.83 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  50.88 
 
 		 308 aa  57.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 		 710 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.77 
 
 		 537 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  30.41 
 
 		 948 aa  58.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>