227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4586 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
269 aa  524  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
326 aa  118  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  39.57 
 
 
260 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  37.04 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  39.29 
 
 
278 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
269 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  38.59 
 
 
271 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
290 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  38.62 
 
 
281 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  36.96 
 
 
262 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  38.27 
 
 
278 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  31.68 
 
 
269 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
268 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.2 
 
 
264 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  35.96 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.24 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.46 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  45.36 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
505 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.33 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  32.08 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 
602 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
601 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
542 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
878 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.97 
 
 
810 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
614 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.42 
 
 
614 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
614 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.42 
 
 
626 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.42 
 
 
626 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
502 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.23 
 
 
882 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
614 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.42 
 
 
614 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  33.58 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
3560 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.26 
 
 
882 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
639 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
612 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.99 
 
 
626 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
646 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  30.29 
 
 
762 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.29 
 
 
762 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.9 
 
 
865 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
4489 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  31.76 
 
 
864 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 
686 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  36.08 
 
 
703 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
572 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
3035 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  31.79 
 
 
780 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.15 
 
 
589 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
637 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.61 
 
 
875 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
713 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
767 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
594 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  35.57 
 
 
1677 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.49 
 
 
587 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.09 
 
 
594 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
632 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
789 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
620 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
718 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
1069 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
1406 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.07 
 
 
708 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.05 
 
 
622 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  33.13 
 
 
502 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
636 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
502 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
629 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
611 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.72 
 
 
620 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
612 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  32.43 
 
 
535 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
1827 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.32 
 
 
622 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
615 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
494 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
620 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
466 aa  48.9  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
649 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
649 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
685 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.54 
 
 
1737 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 
635 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.69 
 
 
479 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 
635 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
968 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3493  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234814  normal  0.110605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.54 
 
 
737 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>