More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6361 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  65.37 
 
 		 222 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  51.97 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  53.93 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 197 aa  95.9  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  41.95 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.36 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  34.62 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 333 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  24.71 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  28.06 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  30.12 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  29.57 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  29.45 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  28.4 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  21.39 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>