More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08651 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  100 
 
 		 799 aa  1648    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 776 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 780 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 678 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  31.38 
 
 		 776 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 801 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 763 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 735 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 759 aa  210  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 818 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  26.11 
 
 		 811 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 824 aa  168  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 730 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 732 aa  125  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  20.85 
 
 		 801 aa  99  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 828 aa  87.8  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 692 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 		 694 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 694 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 797 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 693 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 742 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 677 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  28.81 
 
 		 681 aa  77.4  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 751 aa  76.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 681 aa  76.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 828 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 677 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 836 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 744 aa  74.7  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  25.99 
 
 		 1058 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 		 758 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  25 
 
 		 758 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  24.52 
 
 		 758 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 836 aa  72  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 793 aa  72  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 702 aa  71.2  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  21.47 
 
 		 725 aa  71.2  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 758 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 933 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 845 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  21.12 
 
 		 698 aa  70.1  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 734 aa  70.1  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 719 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  27.56 
 
 		 758 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  21.48 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  25.47 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 682 aa  68.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  24.54 
 
 		 1028 aa  68.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  29.17 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 962 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  26.92 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 772 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  21.1 
 
 		 676 aa  66.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  21.1 
 
 		 676 aa  66.6  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 753 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1094 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 751 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 751 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 791 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1036 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 835 aa  65.1  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 698 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 821 aa  65.1  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 733 aa  65.1  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 698 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 702 aa  65.1  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1003 aa  65.1  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  27.55 
 
 		 797 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 681 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 681 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  27.38 
 
 		 1018 aa  64.3  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 682 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 725 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 933 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 698 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 695 aa  63.9  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  27.87 
 
 		 807 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1051 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 699 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 713 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 1004 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 680 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  33.96 
 
 		 778 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 685 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 681 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 685 aa  62  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 723 aa  62  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 731 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.28 
 
 		 600 aa  61.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 772 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 760 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  25 
 
 		 1017 aa  60.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>