136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2837 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 348 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  69.75 
 
 		 468 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  45.43 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  45.43 
 
 		 315 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  44.79 
 
 		 315 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  46.6 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  41.21 
 
 		 509 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  45.34 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  44.38 
 
 		 524 aa  252  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  42.9 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  42.81 
 
 		 311 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  42.41 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  44.64 
 
 		 618 aa  245  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  42.54 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  43.14 
 
 		 527 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  40.53 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.65 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  38.48 
 
 		 1186 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 535 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  34.77 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  35.56 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.97 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  40.23 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  35.28 
 
 		 679 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.49 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.94 
 
 		 367 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  33.24 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  37.37 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.02 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  29.52 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.36 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.7 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.04 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.12 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  28.61 
 
 		 404 aa  135  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.61 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  33.87 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 		 644 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.83 
 
 		 1338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.45 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  30.95 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  29.94 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.26 
 
 		 712 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  30.29 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  30.99 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  29.73 
 
 		 667 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.51 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.06 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  28.73 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  27.65 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  30.85 
 
 		 855 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  32.35 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  25.98 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  27.6 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  29.79 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.46 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.87 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.44 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.59 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.95 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.35 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  29.62 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.4 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.7 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  26.87 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.87 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28.02 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  31.44 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  25.99 
 
 		 829 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.24 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.2 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.91 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.91 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  25.75 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.98 
 
 		 699 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.3 
 
 		 512 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.76 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  26.53 
 
 		 522 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  26.84 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  34.07 
 
 		 472 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  29.1 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 		 504 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  23.28 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 471 aa  50.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 		 636 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 471 aa  49.7  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.69 
 
 		 810 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>