More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_09151 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_09151  mitochondrial exoribonuclease Cyt-4, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01550)  100 
 
 		 1050 aa  2188    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.361435 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04620  exoribonuclease II, putative  24.27 
 
 		 999 aa  162  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  26.96 
 
 		 674 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  28.16 
 
 		 427 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  27.62 
 
 		 671 aa  112  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  27.12 
 
 		 686 aa  111  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  24.54 
 
 		 676 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  27.53 
 
 		 676 aa  99  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  27.3 
 
 		 683 aa  98.2  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  27.81 
 
 		 683 aa  96.3  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  26.17 
 
 		 645 aa  94.7  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  26.32 
 
 		 813 aa  92.4  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  25 
 
 		 424 aa  91.3  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  22.88 
 
 		 716 aa  89.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  24.73 
 
 		 424 aa  89.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  22.69 
 
 		 671 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  22.51 
 
 		 671 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  25.07 
 
 		 863 aa  86.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  23.06 
 
 		 666 aa  84  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1089  ribonuclease II  26.67 
 
 		 691 aa  83.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  24.28 
 
 		 1182 aa  83.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  23.08 
 
 		 704 aa  82.4  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  25.26 
 
 		 819 aa  82.4  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  23.23 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  22.86 
 
 		 861 aa  81.6  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  24.22 
 
 		 842 aa  81.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83466  3'-5' RNA exonuclease complex component  34.48 
 
 		 1146 aa  81.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00000298042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  24.4 
 
 		 755 aa  80.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  23.23 
 
 		 877 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  22.91 
 
 		 803 aa  79.7  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3405  ribonuclease II  27.04 
 
 		 707 aa  79.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.185041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  24.61 
 
 		 777 aa  79.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  26.04 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  20.24 
 
 		 737 aa  78.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  23.26 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  24.08 
 
 		 751 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  22.6 
 
 		 857 aa  78.2  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  22.46 
 
 		 857 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  24.35 
 
 		 813 aa  77.4  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0937  ribonuclease II  25.63 
 
 		 686 aa  77.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.371224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  22.57 
 
 		 828 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  25.57 
 
 		 795 aa  76.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  20.98 
 
 		 857 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  23.1 
 
 		 757 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  22.6 
 
 		 876 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  22.32 
 
 		 619 aa  75.5  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  23.56 
 
 		 709 aa  75.1  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  22.06 
 
 		 722 aa  75.1  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  22.85 
 
 		 859 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  22.85 
 
 		 857 aa  74.7  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  22.55 
 
 		 766 aa  74.3  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  23.88 
 
 		 795 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  23.59 
 
 		 907 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  21.75 
 
 		 665 aa  73.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  24.58 
 
 		 805 aa  73.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  23.86 
 
 		 680 aa  73.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3203  RNAse R  24.15 
 
 		 842 aa  73.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.62845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3411  ribonuclease II  26.94 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3199  hypothetical protein  25.07 
 
 		 685 aa  73.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0554772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  22.89 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3909  ribonuclease II  24.71 
 
 		 637 aa  72.8  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  24.4 
 
 		 770 aa  72.4  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  23.1 
 
 		 718 aa  72.4  0.00000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  22.07 
 
 		 910 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  23.7 
 
 		 906 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3785  ribonuclease R  22.72 
 
 		 748 aa  71.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  24.87 
 
 		 758 aa  71.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  24.6 
 
 		 771 aa  71.2  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  24.12 
 
 		 795 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  20.82 
 
 		 694 aa  71.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  23.1 
 
 		 818 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  22.46 
 
 		 857 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1583  ribonuclease R  23.81 
 
 		 641 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4583  Exoribonuclease II  30.5 
 
 		 601 aa  71.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2195  ribonuclease II  25.46 
 
 		 702 aa  70.1  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  21.46 
 
 		 770 aa  70.1  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0037  ribonuclease R  30.94 
 
 		 745 aa  70.1  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  24.32 
 
 		 670 aa  70.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  23.85 
 
 		 788 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  23.7 
 
 		 791 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  23.42 
 
 		 895 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  22.7 
 
 		 858 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  25.46 
 
 		 840 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  24.02 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0359  ribonuclease II  34.91 
 
 		 433 aa  70.1  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  22.1 
 
 		 394 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  28.67 
 
 		 746 aa  69.7  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  33.12 
 
 		 715 aa  69.7  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  23.87 
 
 		 770 aa  69.3  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1646  ribonuclease R  28.57 
 
 		 781 aa  69.3  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.353487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  28.67 
 
 		 746 aa  69.7  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  22.51 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  22.51 
 
 		 751 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  23.68 
 
 		 871 aa  69.3  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  26.86 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1126  RNAse R  29.33 
 
 		 752 aa  68.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0050  ribonuclease R  22.16 
 
 		 750 aa  68.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  23.64 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  23.16 
 
 		 903 aa  68.6  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  22.82 
 
 		 870 aa  68.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>