More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3289 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  100 
 
 		 995 aa  2018    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  42.65 
 
 		 692 aa  257  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  34.32 
 
 		 852 aa  220  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  37.53 
 
 		 957 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  39.9 
 
 		 1150 aa  108  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  45.14 
 
 		 3197 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  42.35 
 
 		 3197 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  40.84 
 
 		 792 aa  99.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  36.02 
 
 		 963 aa  97.8  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  41.34 
 
 		 1565 aa  97.8  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  33.98 
 
 		 528 aa  95.5  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  34.59 
 
 		 480 aa  93.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  37.7 
 
 		 2554 aa  90.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  42.2 
 
 		 918 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.78 
 
 		 1094 aa  89  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  30.67 
 
 		 735 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  34.36 
 
 		 861 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.26 
 
 		 910 aa  87  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  39.39 
 
 		 734 aa  86.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  34.62 
 
 		 938 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  34.16 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  34.87 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.98 
 
 		 1732 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1667 aa  84.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  35.76 
 
 		 1862 aa  84  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  36.02 
 
 		 3295 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  36.9 
 
 		 679 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  37.41 
 
 		 2066 aa  83.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.47 
 
 		 945 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  33.51 
 
 		 752 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  38.8 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  32.78 
 
 		 1528 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  35 
 
 		 2036 aa  82.4  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  35.07 
 
 		 1602 aa  82  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  31.25 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  33.96 
 
 		 1236 aa  82  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  33.73 
 
 		 816 aa  81.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  36.31 
 
 		 669 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  31.55 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  39.01 
 
 		 958 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.31 
 
 		 816 aa  80.9  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.63 
 
 		 581 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.51 
 
 		 2000 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  35.26 
 
 		 317 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  44.44 
 
 		 3507 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 1356 aa  80.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  29.27 
 
 		 675 aa  80.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.33 
 
 		 547 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.39 
 
 		 1842 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  31.38 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  31.91 
 
 		 1667 aa  79  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  33.18 
 
 		 1620 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  29.17 
 
 		 658 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  30.41 
 
 		 791 aa  79  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  32.93 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  39.13 
 
 		 1916 aa  78.2  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  35.45 
 
 		 1969 aa  77.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  41.57 
 
 		 340 aa  77.4  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 859 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.14 
 
 		 2122 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  37.34 
 
 		 940 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 		 845 aa  76.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  29.95 
 
 		 941 aa  77  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  34.01 
 
 		 978 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.52 
 
 		 802 aa  76.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.34 
 
 		 953 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.63 
 
 		 930 aa  75.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  29.55 
 
 		 685 aa  75.5  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40.32 
 
 		 1095 aa  75.5  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  35.71 
 
 		 865 aa  75.1  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  30.71 
 
 		 1231 aa  75.1  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  48.05 
 
 		 971 aa  74.7  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  50 
 
 		 1018 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  39.34 
 
 		 719 aa  74.7  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  46.75 
 
 		 971 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  46.75 
 
 		 971 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  46.75 
 
 		 971 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  41.41 
 
 		 519 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  32.09 
 
 		 560 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  36.43 
 
 		 951 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  46.75 
 
 		 971 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  35.1 
 
 		 2176 aa  74.3  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  33.54 
 
 		 184 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  34.97 
 
 		 1230 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  34.96 
 
 		 2552 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  35.22 
 
 		 838 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  35.06 
 
 		 409 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1682 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  46.75 
 
 		 971 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  38.41 
 
 		 1057 aa  72.8  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  28.07 
 
 		 1120 aa  72.8  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 840 aa  72.8  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  34.32 
 
 		 1361 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1282 aa  72.4  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  35.06 
 
 		 930 aa  72  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  31.48 
 
 		 644 aa  72  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  32.39 
 
 		 408 aa  72  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  50 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  32.47 
 
 		 615 aa  72  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  35.86 
 
 		 873 aa  71.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>