More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0792 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0792  diguanylate cyclase  100 
 
 		 654 aa  1344    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000521714  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0890  MadN protein  37.5 
 
 		 649 aa  444  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00448941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0162  endonuclease IV  37.5 
 
 		 649 aa  431  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2826  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.66 
 
 		 649 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.525997  normal  0.15588 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0208  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.85 
 
 		 645 aa  267  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0131  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.95 
 
 		 648 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.91 
 
 		 642 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0124446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1217  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  25.64 
 
 		 650 aa  229  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3058  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  25.64 
 
 		 650 aa  228  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0860  hypothetical protein  27.62 
 
 		 639 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0891  hypothetical protein  27.01 
 
 		 639 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5064  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.4 
 
 		 648 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.303176  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3264  putative diguanylate phosphodiesterase  27.68 
 
 		 639 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00516695  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0183  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.04 
 
 		 648 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4323  GGDEF domain-containing protein  27.92 
 
 		 639 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0378  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.62 
 
 		 639 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0227071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.62 
 
 		 639 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0402432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0376  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.47 
 
 		 639 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0574936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3597  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.25 
 
 		 639 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3764  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.66 
 
 		 637 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4010  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.12 
 
 		 639 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0378  histidine kinase  27.44 
 
 		 640 aa  210  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0165  GGDEF domain-containing protein  26.44 
 
 		 648 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.17 
 
 		 640 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00766642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.44 
 
 		 648 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181368  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0307  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.41 
 
 		 640 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.97 
 
 		 639 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3911  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  27.53 
 
 		 639 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4104  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.53 
 
 		 639 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.950897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1079  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.47 
 
 		 663 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0430  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.88 
 
 		 640 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.612077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0471  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.74 
 
 		 640 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1808  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.9 
 
 		 650 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38633  normal  0.679968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45930  hypothetical protein  26.44 
 
 		 650 aa  197  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0362  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.28 
 
 		 639 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0308  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.23 
 
 		 637 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1449  cyclic-di-GMP regulatory protein  26.07 
 
 		 640 aa  193  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3896  hypothetical protein  24.92 
 
 		 650 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165202  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07087  hypothetical protein  24.5 
 
 		 640 aa  188  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3354  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.35 
 
 		 637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.79801  normal  0.640846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02471  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.85 
 
 		 645 aa  183  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.323013  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001009  GGDEF and EAL domain-containing protein  24.61 
 
 		 627 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1099  membrane signal transduction protein  24.32 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1371  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.11 
 
 		 696 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1309  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  25 
 
 		 635 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.939066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0160  hypothetical protein  23.66 
 
 		 636 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1878  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.12 
 
 		 638 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2095  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.58 
 
 		 632 aa  144  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3441  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.72 
 
 		 663 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.79 
 
 		 703 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.311559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2167  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.16 
 
 		 634 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000207311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.6 
 
 		 634 aa  124  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.85 
 
 		 634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115301  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4116  regulatory protein CsrD  23.27 
 
 		 631 aa  118  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.28 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.151279  normal  0.188336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.75 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000494856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0449  regulatory protein CsrD  23.22 
 
 		 635 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2507  GGDEF domain-containing protein  22.98 
 
 		 634 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2045  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.78 
 
 		 632 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.289313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2272  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.53 
 
 		 634 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000104677  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.76 
 
 		 634 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4544  hypothetical protein  22.32 
 
 		 634 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2258  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.32 
 
 		 634 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000255268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2066  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.53 
 
 		 634 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000803773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1352  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.07 
 
 		 818 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3668  regulatory protein CsrD  23.47 
 
 		 636 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0461  regulatory protein CsrD  23.08 
 
 		 636 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.07 
 
 		 818 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260128  decreased coverage  0.0078854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1368  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.26 
 
 		 818 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.567434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1761  sensory box protein/GGDEF family protein  24.07 
 
 		 973 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3491  regulatory protein CsrD  23.94 
 
 		 636 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0555  regulatory protein CsrD  24.52 
 
 		 634 aa  103  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3756  regulatory protein CsrD  22.13 
 
 		 636 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2197  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.49 
 
 		 623 aa  102  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482206  normal  0.318033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4658  hypothetical protein  22.87 
 
 		 818 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2021  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  23.28 
 
 		 811 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2065  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.71 
 
 		 642 aa  100  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000551747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.84 
 
 		 853 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53140  hypothetical protein  23.49 
 
 		 823 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2662  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.46 
 
 		 640 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1737  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  22.35 
 
 		 818 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0171  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.62 
 
 		 808 aa  97.8  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000289521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3655  PAS:GGDEF  22.17 
 
 		 820 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.979803  normal  0.755172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0503  regulatory protein CsrD  24.31 
 
 		 647 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3840  regulatory protein CsrD  24.07 
 
 		 647 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1144  signal transduction protein  22.11 
 
 		 571 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0479  regulatory protein CsrD  24.07 
 
 		 647 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0500  regulatory protein CsrD  24.07 
 
 		 647 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4086  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.04 
 
 		 820 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0022  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.12 
 
 		 1499 aa  94.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.5 
 
 		 810 aa  94.7  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0539  regulatory protein CsrD  24.47 
 
 		 636 aa  94.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2171  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.86 
 
 		 632 aa  94.4  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1562  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.55 
 
 		 610 aa  94  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66295  normal  0.802083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.27 
 
 		 1169 aa  94  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.49 
 
 		 685 aa  93.6  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1222  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.37 
 
 		 815 aa  93.6  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2352  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.57 
 
 		 638 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1829  putative diguanylate phosphodiesterase  20.62 
 
 		 646 aa  92.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0228515  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2778  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.59 
 
 		 1010 aa  92  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>