More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1856 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 
429 aa  840    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  55.69 
 
 
412 aa  414  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  43.53 
 
 
429 aa  340  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30.7 
 
 
459 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.07 
 
 
464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.07 
 
 
464 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.59 
 
 
469 aa  153  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.77 
 
 
458 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  27.95 
 
 
450 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.68 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.68 
 
 
484 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  27.15 
 
 
547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  27.15 
 
 
546 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  27.15 
 
 
547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
495 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
450 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.91 
 
 
484 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.81 
 
 
495 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  26.62 
 
 
480 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  28.9 
 
 
502 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
446 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  28.44 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.84 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  27.57 
 
 
474 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
442 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
456 aa  133  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
464 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.86 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.58 
 
 
474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  27.48 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  25.58 
 
 
474 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
464 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  24.36 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.17 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.29 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.14 
 
 
461 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
459 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  25.58 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.35 
 
 
464 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
464 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.94 
 
 
445 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.94 
 
 
463 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
475 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.2 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  25.64 
 
 
484 aa  120  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  26.41 
 
 
454 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
464 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.61 
 
 
455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.46 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  22.3 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  20.14 
 
 
453 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  24.15 
 
 
446 aa  113  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
468 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
458 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.95 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.56 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  25.75 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.8 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
469 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.92 
 
 
446 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  21.66 
 
 
462 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
453 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
448 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  25.74 
 
 
457 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
446 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  23.92 
 
 
460 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  26.09 
 
 
462 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  26.15 
 
 
439 aa  103  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.88 
 
 
477 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.41 
 
 
452 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.22 
 
 
461 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  23.61 
 
 
446 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  24.43 
 
 
446 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
462 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.81 
 
 
555 aa  100  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  22.89 
 
 
448 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.69 
 
 
450 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
469 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.04 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  24.72 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
467 aa  97.8  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  23.46 
 
 
453 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
447 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  23.76 
 
 
439 aa  97.4  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.08 
 
 
475 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  20.56 
 
 
462 aa  97.4  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  23.53 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
447 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.91 
 
 
447 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.19 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  23.7 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>