151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1805 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  100 
 
 		 708 aa  1379    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.41 
 
 		 788 aa  210  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  30.71 
 
 		 715 aa  195  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.47 
 
 		 981 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.8 
 
 		 915 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  30.55 
 
 		 797 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 1025 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  37.12 
 
 		 956 aa  180  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  29.39 
 
 		 913 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.83 
 
 		 1088 aa  177  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 919 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  29.03 
 
 		 792 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  28.93 
 
 		 1020 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  30.76 
 
 		 970 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  28.44 
 
 		 715 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  38.24 
 
 		 990 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 1022 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  33.75 
 
 		 690 aa  160  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.35 
 
 		 967 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  29.2 
 
 		 946 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  30.13 
 
 		 993 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 907 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 850 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.56 
 
 		 790 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.07 
 
 		 992 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  28.61 
 
 		 930 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  28.96 
 
 		 937 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  28.31 
 
 		 996 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  28.14 
 
 		 965 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  30.44 
 
 		 941 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.46 
 
 		 1030 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 1033 aa  150  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  32.96 
 
 		 838 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 755 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  28.93 
 
 		 1008 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.06 
 
 		 1027 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.33 
 
 		 921 aa  146  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  28.05 
 
 		 928 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 1054 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.88 
 
 		 908 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.69 
 
 		 990 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  27.5 
 
 		 1010 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  28.55 
 
 		 1071 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  30.44 
 
 		 792 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  28.98 
 
 		 921 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.06 
 
 		 1030 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  27.99 
 
 		 834 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  34.93 
 
 		 935 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.31 
 
 		 931 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 		 814 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  32.28 
 
 		 995 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  27.81 
 
 		 907 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 775 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  28.22 
 
 		 1022 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  28.24 
 
 		 934 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  29.8 
 
 		 854 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.46 
 
 		 783 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30.19 
 
 		 941 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  30.19 
 
 		 1034 aa  134  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.53 
 
 		 983 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  30.98 
 
 		 1003 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  26.76 
 
 		 1017 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 757 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 964 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  30.39 
 
 		 1003 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 1048 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 1014 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  34.74 
 
 		 782 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  27.93 
 
 		 982 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.17 
 
 		 962 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  28.3 
 
 		 1011 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3944  Tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 705 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664408  normal  0.0198084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  27.84 
 
 		 928 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.4 
 
 		 1108 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30.02 
 
 		 993 aa  124  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 1003 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  30.4 
 
 		 761 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 654 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 940 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  29.07 
 
 		 687 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 1138 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 926 aa  114  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  33.79 
 
 		 989 aa  114  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  27.64 
 
 		 981 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  30.09 
 
 		 910 aa  114  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 621 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 		 770 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  27.48 
 
 		 971 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 742 aa  111  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  30.62 
 
 		 978 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5633  NB-ARC domain-containing protein  26.97 
 
 		 744 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345268  normal  0.0245797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  26.51 
 
 		 827 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  30.28 
 
 		 1004 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 963 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  28.64 
 
 		 1013 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  30.4 
 
 		 1001 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  28.89 
 
 		 954 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 680 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.78 
 
 		 910 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>