More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2876 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  56.86 
 
 		 945 aa  697    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 936 aa  1921    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  54.56 
 
 		 1047 aa  557  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  49.44 
 
 		 800 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  50.23 
 
 		 1182 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  60.18 
 
 		 1248 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 886 aa  333  9e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 819 aa  333  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  52.67 
 
 		 1289 aa  324  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 746 aa  313  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 		 721 aa  313  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  31.53 
 
 		 1265 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  46.61 
 
 		 676 aa  299  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  50.9 
 
 		 657 aa  294  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 1255 aa  275  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 892 aa  252  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  53.7 
 
 		 918 aa  251  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1210 aa  251  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 1758 aa  248  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 1341 aa  247  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 704 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.04 
 
 		 1047 aa  244  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.56 
 
 		 1047 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  34.9 
 
 		 754 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  43.71 
 
 		 1019 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 2072 aa  232  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 3706 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  44.34 
 
 		 449 aa  231  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  31.06 
 
 		 689 aa  230  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 1654 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 492 aa  226  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 980 aa  225  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 862 aa  221  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 682 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 		 834 aa  206  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 2693 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 1714 aa  198  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3647  hypothetical protein  57.33 
 
 		 305 aa  193  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 1093 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 1093 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 991 aa  191  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  35.25 
 
 		 783 aa  190  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 839 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 439 aa  181  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 572 aa  178  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 1253 aa  178  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  29.54 
 
 		 713 aa  177  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 1109 aa  177  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 		 814 aa  175  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  26.53 
 
 		 1560 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  35.09 
 
 		 965 aa  173  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 637 aa  173  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 1676 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 1239 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 462 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 727 aa  165  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 802 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 771 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 964 aa  161  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 488 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 681 aa  158  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.75 
 
 		 935 aa  155  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 551 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 613 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.34 
 
 		 1501 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 1068 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1053  sensor domain-like protein  31.56 
 
 		 258 aa  154  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 1118 aa  151  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.58 
 
 		 935 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0882428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 1246 aa  148  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 526 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 1273 aa  146  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 723 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 815 aa  146  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 764 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 912 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  25.21 
 
 		 744 aa  145  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 932 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  28.5 
 
 		 1969 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3111  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  36 
 
 		 213 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 1390 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 732 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 741 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.33 
 
 		 1278 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 1560 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 		 1344 aa  141  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 767 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 631 aa  140  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.2 
 
 		 1663 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.22 
 
 		 1432 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  34.46 
 
 		 551 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 602 aa  140  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 1177 aa  139  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.73 
 
 		 1668 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 913 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.46 
 
 		 791 aa  138  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 347 aa  138  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  27.05 
 
 		 1561 aa  138  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0600  putative PAS/PAC sensor protein  34.04 
 
 		 727 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000188746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 382 aa  137  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>