165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0923 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 379 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  47.29 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  44.38 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  39.55 
 
 		 395 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  41.04 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  40.79 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.77 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  32.58 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  32.06 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  34.84 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  30.56 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  28.66 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  29.63 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  29.56 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  27.04 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.75 
 
 		 831 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  34.38 
 
 		 627 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  28.25 
 
 		 355 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.2 
 
 		 930 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  27.39 
 
 		 361 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.47 
 
 		 668 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  30.32 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.12 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  32.11 
 
 		 522 aa  106  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.67 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  29.21 
 
 		 676 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  26.69 
 
 		 319 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  27.47 
 
 		 579 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  30.41 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.85 
 
 		 752 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.96 
 
 		 588 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.31 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  25.78 
 
 		 359 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 491 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  37.5 
 
 		 930 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.68 
 
 		 525 aa  87  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.06 
 
 		 709 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  25.47 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.57 
 
 		 1293 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  31.58 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  29.24 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.16 
 
 		 1146 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  27.19 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1163 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.45 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  35.81 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  30.43 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27 
 
 		 1140 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  28.33 
 
 		 906 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  28.82 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  27.59 
 
 		 700 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.61 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1030 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  29.07 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  28.07 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.17 
 
 		 888 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  25.27 
 
 		 899 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1177 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1230 aa  66.6  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  40.74 
 
 		 716 aa  66.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  29.65 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  27.8 
 
 		 898 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.32 
 
 		 1351 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1834 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  25.28 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  27.7 
 
 		 664 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  22.49 
 
 		 686 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  24.29 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  24.78 
 
 		 684 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  26.06 
 
 		 668 aa  62  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.33 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  24.27 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  23.33 
 
 		 678 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1068 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1667 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  25.32 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  27.27 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.57 
 
 		 693 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  25.42 
 
 		 937 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 732 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  26.46 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  27.08 
 
 		 913 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.46 
 
 		 963 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  25.97 
 
 		 1079 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  24.81 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  25.93 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.29 
 
 		 1292 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  29.34 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  24.67 
 
 		 521 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  23.73 
 
 		 903 aa  56.2  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  31.58 
 
 		 680 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  27.54 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  26.56 
 
 		 510 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  23.98 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  24.79 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  22.45 
 
 		 892 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 		 1026 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26 
 
 		 1051 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>