More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2978 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  100 
 
 
377 aa  746  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  48.81 
 
 
379 aa  332  7e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  48.81 
 
 
379 aa  332  7e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  39.19 
 
 
390 aa  272  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  41.69 
 
 
477 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  39.79 
 
 
400 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  37.66 
 
 
392 aa  265  9e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  41.47 
 
 
379 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  43.53 
 
 
378 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  42.02 
 
 
377 aa  252  8e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  36.61 
 
 
414 aa  234  2e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  38.15 
 
 
426 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  38.01 
 
 
371 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  38.89 
 
 
381 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  36.54 
 
 
363 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  37.41 
 
 
422 aa  222  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  35.73 
 
 
422 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  35.34 
 
 
386 aa  209  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  33.51 
 
 
391 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  36.13 
 
 
431 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  41.72 
 
 
305 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  35.84 
 
 
385 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  37.5 
 
 
402 aa  201  2e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.85 
 
 
387 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  35.56 
 
 
416 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  37.37 
 
 
374 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  36.05 
 
 
383 aa  189  6e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  32.29 
 
 
325 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  32.88 
 
 
383 aa  183  5e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  30.29 
 
 
370 aa  183  5e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  32.74 
 
 
392 aa  183  5e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  33.16 
 
 
435 aa  182  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  34.02 
 
 
406 aa  180  3e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  30.06 
 
 
369 aa  179  6e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.57 
 
 
374 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.57 
 
 
374 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  37.91 
 
 
404 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  31.81 
 
 
368 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  30.26 
 
 
370 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  31.03 
 
 
443 aa  174  3e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.65 
 
 
369 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.65 
 
 
369 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  32.09 
 
 
407 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  35.45 
 
 
378 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  42 
 
 
471 aa  164  2e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  34.63 
 
 
463 aa  163  4e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  41.6 
 
 
471 aa  163  4e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  29.66 
 
 
388 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  33.09 
 
 
416 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  38.58 
 
 
391 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  31.16 
 
 
437 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.68 
 
 
389 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  28.54 
 
 
445 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  28.54 
 
 
445 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  32.46 
 
 
503 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  34.61 
 
 
409 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  38.65 
 
 
487 aa  147  4e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  29.01 
 
 
656 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.89 
 
 
381 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.8 
 
 
451 aa  145  8e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  32.93 
 
 
391 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  29.48 
 
 
494 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.61 
 
 
381 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  32.28 
 
 
357 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  29.7 
 
 
507 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.59 
 
 
413 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  36.01 
 
 
370 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  27.33 
 
 
378 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  30.39 
 
 
506 aa  134  2e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.91844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  34.73 
 
 
365 aa  132  8e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.98 
 
 
398 aa  131  2e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  32.41 
 
 
403 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  28.62 
 
 
373 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  33.33 
 
 
385 aa  127  4e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26.3 
 
 
386 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  30.56 
 
 
367 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  34.46 
 
 
397 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.63 
 
 
376 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.63 
 
 
376 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  27.03 
 
 
393 aa  122  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  28.23 
 
 
376 aa  120  4e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.13824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  32.81 
 
 
442 aa  120  4e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  32.94 
 
 
393 aa  120  5e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.51 
 
 
376 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.45 
 
 
376 aa  119  1e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.61 
 
 
388 aa  116  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  30.49 
 
 
376 aa  116  7e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  30.31 
 
 
387 aa  115  9e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  30 
 
 
383 aa  115  9e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  30.83 
 
 
492 aa  115  1e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  29.38 
 
 
460 aa  115  1e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.73 
 
 
454 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  34.26 
 
 
458 aa  114  4e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  30.81 
 
 
377 aa  114  4e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  35.77 
 
 
396 aa  112  1e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  33.33 
 
 
209 aa  111  2e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  25.15 
 
 
362 aa  109  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  27.24 
 
 
393 aa  109  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  28.47 
 
 
508 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  29.81 
 
 
378 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>