More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4229 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 889 aa  743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 923 aa  1802    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  70.95 
 
 		 953 aa  1278    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 928 aa  349  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  34.8 
 
 		 929 aa  263  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 936 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 		 928 aa  218  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 911 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  32.84 
 
 		 913 aa  205  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  38.29 
 
 		 928 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  36.83 
 
 		 922 aa  195  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  36.21 
 
 		 930 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  38.56 
 
 		 940 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 950 aa  187  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  29.33 
 
 		 917 aa  187  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 995 aa  184  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 937 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.56 
 
 		 937 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 904 aa  171  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 894 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.31 
 
 		 937 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 925 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  33.59 
 
 		 934 aa  165  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.56 
 
 		 923 aa  164  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  35.05 
 
 		 929 aa  162  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.24 
 
 		 913 aa  161  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 918 aa  162  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 946 aa  161  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.44 
 
 		 919 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 920 aa  160  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  36.09 
 
 		 923 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 1064 aa  155  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  35.7 
 
 		 919 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  40.25 
 
 		 903 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  34.07 
 
 		 955 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 905 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 938 aa  143  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 913 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 927 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  34.64 
 
 		 961 aa  140  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 910 aa  138  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.22 
 
 		 884 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  38.31 
 
 		 927 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  31.72 
 
 		 916 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  40 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 919 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.52 
 
 		 919 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.52 
 
 		 919 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.08 
 
 		 879 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  29.5 
 
 		 919 aa  102  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  30.22 
 
 		 900 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  52.38 
 
 		 892 aa  97.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  33.44 
 
 		 884 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  36.23 
 
 		 977 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  27.9 
 
 		 959 aa  94.4  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 910 aa  91.7  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.28 
 
 		 921 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 921 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.02 
 
 		 921 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  38.34 
 
 		 940 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.27 
 
 		 997 aa  88.2  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  28.93 
 
 		 921 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.91 
 
 		 923 aa  87.8  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  29.79 
 
 		 929 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 909 aa  85.5  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  30.64 
 
 		 960 aa  78.2  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 947 aa  78.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 998 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  36.09 
 
 		 915 aa  77  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 1000 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 946 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 952 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  26.2 
 
 		 1006 aa  70.5  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  29.34 
 
 		 948 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 189 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  35.9 
 
 		 893 aa  70.5  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.77 
 
 		 1029 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  26.74 
 
 		 897 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 881 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 967 aa  69.7  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 881 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 876 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 1190 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  41.56 
 
 		 998 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 932 aa  67.8  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 907 aa  67.8  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 894 aa  67.8  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 		 953 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  28.83 
 
 		 956 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 877 aa  65.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  28.14 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 1015 aa  65.1  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  32.09 
 
 		 955 aa  65.1  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  44.64 
 
 		 862 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 983 aa  64.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  26.68 
 
 		 1402 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  46.91 
 
 		 959 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 973 aa  63.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 895 aa  62.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.57 
 
 		 1264 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>