117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4750 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
279 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  71.56 
 
 
211 aa  315  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  49.27 
 
 
284 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  32.06 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  32.4 
 
 
322 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  31.01 
 
 
326 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  31.12 
 
 
323 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  34.3 
 
 
318 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  30.28 
 
 
318 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  29.58 
 
 
328 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  31.76 
 
 
364 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  29.22 
 
 
346 aa  92.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.01 
 
 
579 aa  88.6  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.69 
 
 
930 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  29.38 
 
 
588 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32.6 
 
 
831 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  33.53 
 
 
676 aa  85.9  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.63 
 
 
418 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  24.26 
 
 
752 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  27.38 
 
 
1293 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  34.73 
 
 
1030 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
668 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.61 
 
 
709 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.4 
 
 
930 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  34.43 
 
 
627 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.85 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.98 
 
 
522 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  23.68 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25.68 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  34.5 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  30.65 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4761  NHL repeat-containing protein  70.21 
 
 
70 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  24.76 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.57 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.65 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  42.42 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.06 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  30.12 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.14 
 
 
700 aa  66.2  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.68 
 
 
1068 aa  65.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.07 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  27.67 
 
 
373 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.49 
 
 
525 aa  63.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  29.52 
 
 
319 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  24.01 
 
 
371 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  33.91 
 
 
372 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  28.82 
 
 
436 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  36.04 
 
 
391 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  44.3 
 
 
395 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  26.44 
 
 
343 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  34.78 
 
 
347 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.33 
 
 
1163 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  24.44 
 
 
343 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.5 
 
 
365 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  24.39 
 
 
379 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.83 
 
 
354 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  26.67 
 
 
1146 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.73 
 
 
693 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  27.01 
 
 
412 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  24.78 
 
 
377 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  36.9 
 
 
888 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  24.47 
 
 
363 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 
786 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  39.51 
 
 
355 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  32.76 
 
 
396 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.71 
 
 
1834 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  29.77 
 
 
684 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.17 
 
 
355 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.69 
 
 
384 aa  52.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  32.43 
 
 
386 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  26.78 
 
 
711 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15206  peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase-like protein  32.09 
 
 
774 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.002705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.05 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.79 
 
 
898 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.04 
 
 
372 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.11 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.63 
 
 
1140 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  28.83 
 
 
343 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  29.59 
 
 
361 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  28.26 
 
 
521 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.96 
 
 
439 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  31.68 
 
 
903 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25 
 
 
1292 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  23.13 
 
 
1750 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  30.68 
 
 
453 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.64 
 
 
314 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  26.34 
 
 
368 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1230 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  24.17 
 
 
646 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  28.45 
 
 
379 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
850 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  26.4 
 
 
899 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  25.74 
 
 
360 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.09 
 
 
305 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  23.91 
 
 
841 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
678 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  28.35 
 
 
1079 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  37.08 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  37.08 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>