More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1652 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1586  diguanylate cyclase  91.24 
 
 		 491 aa  914    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1652  diguanylate cyclase  100 
 
 		 490 aa  993    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.749875  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  38.1 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  34.52 
 
 		 620 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1690  diguanylate cyclase  36.79 
 
 		 331 aa  106  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1520  GGDEF domain-containing protein  34.25 
 
 		 323 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2736  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.26 
 
 		 748 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  32.44 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  39.24 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  33.94 
 
 		 489 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.15 
 
 		 896 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  36.77 
 
 		 427 aa  103  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1484  diguanylate cyclase  32.29 
 
 		 615 aa  103  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1842  diguanylate cyclase  31.28 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.721538  normal  0.677546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1325  sensory box protein  34.67 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2668  diguanylate cyclase  34.05 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2119  response regulatory protein  33.64 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3185  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.98 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.07 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0308  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 581 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1528  diguanylate cyclase  38.51 
 
 		 1339 aa  99.8  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.646539  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0265  diguanylate cyclase  35.5 
 
 		 456 aa  99.8  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 488 aa  99.8  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1202  GGDEF domain-containing protein  34.25 
 
 		 324 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3131  diguanylate cyclase  32.78 
 
 		 328 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388366 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1003  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.52 
 
 		 538 aa  99.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1073  diguanylate cyclase  34.39 
 
 		 278 aa  99  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0443  diguanylate cyclase  33.93 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  34.42 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  34.42 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  30.68 
 
 		 569 aa  98.2  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1200  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.57 
 
 		 619 aa  98.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  34.42 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3185  diguanylate cyclase  36.61 
 
 		 347 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.0939676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02711  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.32 
 
 		 605 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.407326  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  37.08 
 
 		 555 aa  98.2  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.55 
 
 		 643 aa  98.2  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1205  diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 371 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1635  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.55 
 
 		 643 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1737  diguanylate cyclase  33.71 
 
 		 390 aa  97.4  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1067  diguanylate cyclase  34.24 
 
 		 490 aa  97.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0267  diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 1320 aa  97.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  33.51 
 
 		 733 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0267  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.77 
 
 		 500 aa  97.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1365  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 276 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134313  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4684  GGDEF domain-containing protein  33.51 
 
 		 266 aa  97.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2868  diguanylate cyclase  32.61 
 
 		 293 aa  97.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.901439  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2543  diguanylate cyclase  31.21 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000111562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  35.19 
 
 		 565 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0237  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1204  diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 181 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000220024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1153  diguanylate cyclase  35.53 
 
 		 299 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00439515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3838  diguanylate cyclase  38.06 
 
 		 452 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210475  normal  0.0305933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  33.54 
 
 		 526 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0065  response regulator receiver protein  35.44 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  31.55 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  29.61 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.46 
 
 		 1073 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1333  diguanylate cyclase  34.95 
 
 		 259 aa  95.1  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00918762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  29.26 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00332  predicted diguanylate cyclase  30.91 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3223  diguanylate cyclase  30.91 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3247  diguanylate cyclase AdrA  30.91 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0905888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0705  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 311 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2077  diguanylate cyclase  28.32 
 
 		 343 aa  94.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.984314  normal  0.163131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.87 
 
 		 550 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0459  diguanylate cyclase AdrA  30.91 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0415  diguanylate cyclase AdrA  30.91 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1257  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 1203 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1251  diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 240 aa  95.1  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.02 
 
 		 419 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0313  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 577 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3711  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 571 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0726  diguanylate cyclase  32.7 
 
 		 236 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.914342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1484  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.4 
 
 		 555 aa  95.1  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00336  hypothetical protein  30.91 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.91 
 
 		 319 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1199  diguanylate cyclase  32.84 
 
 		 258 aa  94.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  27.75 
 
 		 615 aa  94.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  32.61 
 
 		 347 aa  94.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0302  diguanylate cyclase AdrA  30.91 
 
 		 366 aa  94.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.82 
 
 		 675 aa  94.4  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  31.61 
 
 		 398 aa  94.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1344  diguanylate cyclase  37.34 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.549291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0412  diguanylate cyclase AdrA  30.91 
 
 		 371 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2615  GGDEF domain-containing protein  33.54 
 
 		 294 aa  94.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.41 
 
 		 916 aa  94.4  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0453  diguanylate cyclase AdrA  30.91 
 
 		 371 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6322  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.92 
 
 		 682 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 735 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  34.34 
 
 		 599 aa  94.4  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.94 
 
 		 301 aa  93.6  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0427  diguanylate cyclase AdrA  32.35 
 
 		 370 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>