More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4093 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4093  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  56.65 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2446  TetR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00126454  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  40.89 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  42.49 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  42.74 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  33.11 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  37.29 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  50.88 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 280 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>