More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1034 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3556  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  79.86 
 
 		 420 aa  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1034  diguanylate cyclase  100 
 
 		 417 aa  864    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.283599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2977  diguanylate cyclase with GAF sensor  81.29 
 
 		 420 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00653493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3059  diguanylate cyclase with GAF sensor  81.53 
 
 		 420 aa  694    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0288592  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1135  diguanylate cyclase  99.52 
 
 		 417 aa  862    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1101  diguanylate cyclase  99.52 
 
 		 417 aa  862    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3157  diguanylate cyclase with GAF sensor  81.53 
 
 		 420 aa  692    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00178016  normal  0.867021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3257  diguanylate cyclase with GAF sensor  99.52 
 
 		 417 aa  862    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0304774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1039  diguanylate cyclase  79.61 
 
 		 422 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1222  GGDEF domain-containing protein  63.08 
 
 		 410 aa  511  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1062  GGDEF domain-containing protein  60.15 
 
 		 438 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1332  GGDEF domain-containing protein  57.32 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.228796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0036  diguanylate cyclase  53.47 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  28.95 
 
 		 681 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1200  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28 
 
 		 619 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3568  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  27.74 
 
 		 550 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  37.28 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000065  diguanylate cyclase/phosphodiesterase domain 2  37.65 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3356  GGDEF domain/HAMP domain-containing protein  35.43 
 
 		 533 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.204674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.19 
 
 		 550 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2544  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.54 
 
 		 376 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.108185 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2133  GGDEF family protein  31.7 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.352584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.93 
 
 		 704 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.19 
 
 		 713 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0006  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.29 
 
 		 557 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1056  diguanylate cyclase  29.89 
 
 		 580 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.77678  normal  0.689214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1356  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.21 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.96 
 
 		 686 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 354 aa  91.3  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  28.99 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.52 
 
 		 558 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0896  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.08 
 
 		 397 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.225893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1378  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.08 
 
 		 397 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2736  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.47 
 
 		 748 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3638  diguanylate cyclase  31.36 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.882001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  29.22 
 
 		 688 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3509  diguanylate cyclase  31.36 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 593 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0563  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.86 
 
 		 846 aa  90.1  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0843  diguanylate cyclase  31.36 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 		 623 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.62 
 
 		 769 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1089  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.29 
 
 		 667 aa  89.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.973751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1333  diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 259 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00918762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1650  sensory box protein  34.18 
 
 		 819 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00487383  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0427  diguanylate cyclase AdrA  31.79 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0482  diguanylate cyclase AdrA  31.79 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1059  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.71 
 
 		 570 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0421  diguanylate cyclase AdrA  31.79 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0422  diguanylate cyclase AdrA  31.79 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.01 
 
 		 1082 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0429  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.44 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0440  diguanylate cyclase AdrA  31.79 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  29.76 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.58 
 
 		 550 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  29.76 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  29.76 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1599  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.51 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1290  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.45 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0190271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  29.76 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0071  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.27 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1538  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.11 
 
 		 789 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1193  diguanylate cyclase  34.2 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2111  diguanylate cyclase  36.97 
 
 		 290 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.672445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001647  sensory box/GGDEF family protein  30.49 
 
 		 626 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  29.76 
 
 		 354 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  32.16 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3545  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.12 
 
 		 569 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1425  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.64 
 
 		 483 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  35.54 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3975  GGDEF  32.35 
 
 		 523 aa  86.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.456822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0206  diguanylate cyclase  33.87 
 
 		 556 aa  86.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0661328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  36.36 
 
 		 565 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.6 
 
 		 668 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  32.96 
 
 		 718 aa  86.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2149  diguanylate cyclase  36.59 
 
 		 272 aa  86.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0840549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 		 909 aa  86.7  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.91 
 
 		 668 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  28.77 
 
 		 494 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0005  diguanylate cyclase  32.76 
 
 		 520 aa  86.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 591 aa  86.3  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00827  hypothetical protein  31.33 
 
 		 626 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1949  sensory box protein  33.33 
 
 		 654 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  30.84 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0197  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 507 aa  85.9  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1602  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.74 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00649  Putative signal protein with GGDEF domain  35.76 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  34.12 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.68 
 
 		 1079 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  31.79 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.48 
 
 		 765 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0545  response regulator  32.4 
 
 		 575 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3549  diguanylate cyclase  31.29 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.2 
 
 		 1338 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 791 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00275819  normal  0.0440432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  28.77 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  27.13 
 
 		 554 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>