More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1039 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3556  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  77.48 
 
 		 420 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1101  diguanylate cyclase  79.37 
 
 		 417 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1034  diguanylate cyclase  79.61 
 
 		 417 aa  674    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.283599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1135  diguanylate cyclase  79.37 
 
 		 417 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3257  diguanylate cyclase with GAF sensor  79.37 
 
 		 417 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0304774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1039  diguanylate cyclase  100 
 
 		 422 aa  868    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2977  diguanylate cyclase with GAF sensor  79.18 
 
 		 420 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00653493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3059  diguanylate cyclase with GAF sensor  79.18 
 
 		 420 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0288592  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3157  diguanylate cyclase with GAF sensor  79.42 
 
 		 420 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00178016  normal  0.867021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1222  GGDEF domain-containing protein  61.63 
 
 		 410 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1062  GGDEF domain-containing protein  57.56 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1332  GGDEF domain-containing protein  56.08 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.228796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0036  diguanylate cyclase  51.36 
 
 		 407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000170685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1200  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.62 
 
 		 619 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2544  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.8 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.108185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0896  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.27 
 
 		 397 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.225893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1378  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.27 
 
 		 397 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1356  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.26 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305567 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3356  GGDEF domain/HAMP domain-containing protein  34.71 
 
 		 533 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.204674  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3568  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  26.8 
 
 		 550 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0098  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.88 
 
 		 642 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1290  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.34 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0190271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.12 
 
 		 769 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  28.62 
 
 		 681 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 275 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 		 474 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 593 aa  96.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4523  diguanylate cyclase  31.84 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114375  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.51 
 
 		 550 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  29.13 
 
 		 688 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1059  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.43 
 
 		 570 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0071  diguanylate cyclase with GAF sensor  31 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4679  diguanylate cyclase  33.75 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.882516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0197  diguanylate cyclase  36.7 
 
 		 507 aa  94.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.38 
 
 		 550 aa  94.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3602  diguanylate cyclase  33.75 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.921669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2736  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.33 
 
 		 748 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.12 
 
 		 686 aa  93.6  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.76 
 
 		 792 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1892  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.13 
 
 		 771 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.8 
 
 		 704 aa  93.2  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.93 
 
 		 781 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1538  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.52 
 
 		 789 aa  93.2  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0429  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.97 
 
 		 431 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  27.59 
 
 		 554 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.22 
 
 		 503 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000065  diguanylate cyclase/phosphodiesterase domain 2  36.48 
 
 		 320 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.84 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1193  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.22 
 
 		 739 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2183  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.13 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645275 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  34.93 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.21 
 
 		 713 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3580  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.16 
 
 		 873 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1056  diguanylate cyclase  32.18 
 
 		 580 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.77678  normal  0.689214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  32.1 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0693  diguanylate cyclase  36.94 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  33.53 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 		 909 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.09 
 
 		 772 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.52 
 
 		 558 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001647  sensory box/GGDEF family protein  32.53 
 
 		 626 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  36.72 
 
 		 1093 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1333  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 259 aa  90.9  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00918762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.48 
 
 		 1072 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6026  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.92 
 
 		 1109 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  34.91 
 
 		 457 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  30.43 
 
 		 494 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  30.43 
 
 		 494 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3979  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.28 
 
 		 567 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000058301  hitchhiker  0.000000371669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  32.32 
 
 		 420 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0735  diguanylate cyclase with GAF sensor  30 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.62 
 
 		 616 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1153  diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 299 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00439515  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  29.95 
 
 		 609 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.15 
 
 		 668 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.15 
 
 		 668 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.89 
 
 		 663 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.96 
 
 		 301 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000161  GGDEF family protein  35.9 
 
 		 652 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44470  transmembrane sensor cyclic di-GMP signal transduction protein  34.32 
 
 		 513 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.73 
 
 		 860 aa  89.7  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  33.33 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.73 
 
 		 880 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2102  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.89 
 
 		 689 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.44 
 
 		 1079 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.1 
 
 		 797 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1036  diguanylate cyclase  30.17 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1806  diguanylate cyclase  31.53 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 882 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  29.95 
 
 		 709 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2744  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.6 
 
 		 708 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0985963  normal  0.64703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.87 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2133  GGDEF family protein  31.98 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.352584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3230  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.56 
 
 		 872 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  32.2 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  28.64 
 
 		 640 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.03 
 
 		 572 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0530  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.72 
 
 		 961 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.639569  normal  0.653911 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05794  hypothetical protein  34.95 
 
 		 652 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>