More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3157 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3556  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  91.9 
 
 		 420 aa  781    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1039  diguanylate cyclase  79.42 
 
 		 422 aa  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1101  diguanylate cyclase  81.53 
 
 		 417 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3257  diguanylate cyclase with GAF sensor  81.53 
 
 		 417 aa  693    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0304774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1135  diguanylate cyclase  81.53 
 
 		 417 aa  693    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2977  diguanylate cyclase with GAF sensor  94.29 
 
 		 420 aa  797    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00653493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3059  diguanylate cyclase with GAF sensor  94.29 
 
 		 420 aa  798    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0288592  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3157  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 		 420 aa  864    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00178016  normal  0.867021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1034  diguanylate cyclase  81.53 
 
 		 417 aa  693    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.283599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1062  GGDEF domain-containing protein  62.38 
 
 		 438 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1222  GGDEF domain-containing protein  64.06 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1332  GGDEF domain-containing protein  57.57 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.228796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0036  diguanylate cyclase  53.32 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000170685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1200  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.14 
 
 		 619 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2544  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.08 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.108185 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3568  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  26.86 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1059  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  28.26 
 
 		 570 aa  99.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  25.71 
 
 		 681 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3356  GGDEF domain/HAMP domain-containing protein  34.41 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.204674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  38.6 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  27.05 
 
 		 688 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56280  hypothetical protein  35.76 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1324  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  28.49 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.799769  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2736  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.04 
 
 		 748 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1538  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.13 
 
 		 789 aa  94.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.65 
 
 		 792 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 591 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1333  diguanylate cyclase  35.42 
 
 		 259 aa  94.4  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00918762  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3080  diguanylate cyclase  33.11 
 
 		 620 aa  93.6  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  31.3 
 
 		 781 aa  93.6  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4901  hypothetical protein  35.76 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 		 909 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  30 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0006  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.47 
 
 		 557 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001647  sensory box/GGDEF family protein  35.33 
 
 		 626 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  23.39 
 
 		 713 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  23.18 
 
 		 704 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3663  diguanylate cyclase  35.36 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.42 
 
 		 593 aa  91.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0206  diguanylate cyclase  34.22 
 
 		 556 aa  90.9  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0661328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3597  diguanylate cyclase  35.36 
 
 		 302 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0645  diguanylate cyclase  35.36 
 
 		 302 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4735  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.91 
 
 		 689 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0595206  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  30.73 
 
 		 321 aa  90.5  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3786  diguanylate cyclase  35.36 
 
 		 302 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.2 
 
 		 355 aa  89.7  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3488  diguanylate cyclase  35.96 
 
 		 302 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.464189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.22 
 
 		 1413 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  28.63 
 
 		 764 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  30.05 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0735  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.97 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  28.63 
 
 		 764 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.18 
 
 		 772 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1290  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.29 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0190271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1056  diguanylate cyclase  29.35 
 
 		 580 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.77678  normal  0.689214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0796  GGDEF family protein  34.64 
 
 		 303 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  32.46 
 
 		 609 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.84 
 
 		 686 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2102  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.9 
 
 		 689 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0896  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.98 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.225893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1378  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.98 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1153  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00439515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.63 
 
 		 558 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4941  sensory box protein  35.03 
 
 		 633 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1323  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  28.21 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1356  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.51 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31 
 
 		 797 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1599  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.21 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0633  diguanylate cyclase  35.39 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.4362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.45 
 
 		 503 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000065  diguanylate cyclase/phosphodiesterase domain 2  35.33 
 
 		 320 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  38.31 
 
 		 1515 aa  87.4  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  32.46 
 
 		 709 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0716  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.5 
 
 		 801 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.317239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  34.27 
 
 		 1093 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3320  diguanylate cyclase  35.39 
 
 		 302 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00827  hypothetical protein  34.81 
 
 		 626 aa  87.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.65 
 
 		 550 aa  87  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2111  diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 290 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.672445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  25.18 
 
 		 523 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.38 
 
 		 769 aa  87  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1425  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.34 
 
 		 483 aa  87  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.73 
 
 		 572 aa  87  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1806  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 291 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1146  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 350 aa  87  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.923994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.5 
 
 		 575 aa  87  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.76 
 
 		 425 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.44 
 
 		 550 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2133  GGDEF family protein  31.11 
 
 		 332 aa  86.7  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.352584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  30.23 
 
 		 499 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.67 
 
 		 836 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  27.75 
 
 		 764 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2183  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.73 
 
 		 336 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.9 
 
 		 689 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  34.5 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.48 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 502 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0100  diguanylate cyclase  30 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.98 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>