167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4447 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 604 aa  1254    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  78.15 
 
 		 604 aa  1025    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  76.49 
 
 		 604 aa  1007    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 628 aa  118  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 567 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  23.96 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 		 564 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 621 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3888  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 589 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.170596  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3887  extracellular solute-binding protein family 5  22.36 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.544175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 735 aa  76.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  21.5 
 
 		 675 aa  75.1  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3340  4-phytase  22.22 
 
 		 608 aa  67  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  21.52 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  22.13 
 
 		 557 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  22.25 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 556 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 		 597 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 788 aa  61.2  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  21.2 
 
 		 693 aa  61.2  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.53 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  21.78 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  20.52 
 
 		 559 aa  58.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.24 
 
 		 525 aa  57  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  21.76 
 
 		 572 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  21.95 
 
 		 616 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  20.82 
 
 		 794 aa  55.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 544 aa  55.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  20.97 
 
 		 527 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 810 aa  55.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  22.14 
 
 		 505 aa  54.7  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 529 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.83 
 
 		 579 aa  54.3  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  23.71 
 
 		 588 aa  54.3  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  21.38 
 
 		 645 aa  53.9  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  21.76 
 
 		 577 aa  53.9  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 779 aa  53.9  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 530 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 		 567 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  20.77 
 
 		 627 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3867  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 621 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 		 529 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000120375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 		 560 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.02 
 
 		 566 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  20.03 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 821 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.92 
 
 		 567 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 787 aa  52.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  19.85 
 
 		 693 aa  51.6  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 551 aa  51.6  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 524 aa  51.6  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 		 596 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  23.43 
 
 		 615 aa  51.2  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3648  extracellular solute-binding protein family 5  21.64 
 
 		 556 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 535 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4083  twin-arginine translocation pathway signal  22.41 
 
 		 626 aa  50.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 682 aa  50.8  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  20.75 
 
 		 545 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2552  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 616 aa  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.437338  normal  0.0565568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 810 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 579 aa  49.7  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  28.78 
 
 		 592 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 		 565 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1545  putative extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 606 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.0971522 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0541  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 		 632 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.843572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  22.02 
 
 		 562 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 526 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.11 
 
 		 616 aa  48.5  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  21.62 
 
 		 517 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.11 
 
 		 615 aa  48.5  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  21.82 
 
 		 587 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  21.38 
 
 		 610 aa  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 602 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  20.72 
 
 		 635 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 542 aa  48.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  22.99 
 
 		 526 aa  48.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0780  extracellular solute-binding protein family 5  22.3 
 
 		 511 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.142319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  23.59 
 
 		 615 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.7 
 
 		 545 aa  48.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 602 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.15 
 
 		 589 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>