More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4518 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
615 aa  1236    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  41.49 
 
 
607 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1656  HAD superfamily ATPase  34.36 
 
 
941 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113065  normal  0.455529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
616 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
675 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
557 aa  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 
693 aa  106  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.44 
 
 
545 aa  104  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 
693 aa  98.6  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 
735 aa  97.1  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
559 aa  93.6  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 
592 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
788 aa  92.8  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  23.15 
 
 
616 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
682 aa  90.5  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
774 aa  87.8  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  23.37 
 
 
596 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  23.74 
 
 
628 aa  84.3  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 
627 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.16 
 
 
587 aa  81.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 
560 aa  80.9  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  33.5 
 
 
790 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
597 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 
621 aa  77  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  36 
 
 
775 aa  77  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  22.18 
 
 
587 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 
559 aa  75.5  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
716 aa  73.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  26.45 
 
 
555 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  22.76 
 
 
603 aa  72.8  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
788 aa  72.8  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  25.6 
 
 
552 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  25.6 
 
 
552 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 
540 aa  72.8  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.36 
 
 
551 aa  72  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2800  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
630 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 
557 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22.91 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 
554 aa  70.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 
569 aa  70.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
787 aa  70.9  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
794 aa  70.9  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
821 aa  70.5  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1608  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
516 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161051  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
529 aa  70.5  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  26.37 
 
 
541 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
793 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 
604 aa  68.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  25.44 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
532 aa  68.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  25.44 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  25.44 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  25.43 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A28  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  22.55 
 
 
529 aa  68.2  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00880825  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  25.44 
 
 
543 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  21.42 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 
629 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  21.42 
 
 
557 aa  67  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.22 
 
 
516 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 
562 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 
781 aa  67  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.72 
 
 
532 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
512 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 
560 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.75 
 
 
559 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.75 
 
 
555 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.56 
 
 
575 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
535 aa  64.7  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
636 aa  64.7  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 
779 aa  64.7  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
810 aa  63.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.56 
 
 
575 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  27.83 
 
 
502 aa  63.9  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
778 aa  63.9  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  25.14 
 
 
558 aa  63.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 
499 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
565 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 
533 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1093  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
629 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0361636  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.25 
 
 
575 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4438  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
538 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.829261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.98 
 
 
507 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 
604 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 
533 aa  62.4  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
626 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0334  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
541 aa  62.4  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.768653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
543 aa  62.4  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 
539 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  25.18 
 
 
605 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
538 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2945  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 
565 aa  61.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472455  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
510 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
593 aa  61.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 
528 aa  61.6  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
552 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
525 aa  61.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 
536 aa  61.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
544 aa  60.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.77 
 
 
564 aa  60.8  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>