35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1848 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
821 aa  1641    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  59.66 
 
 
794 aa  802    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  56.28 
 
 
790 aa  754    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  40.82 
 
 
810 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 
787 aa  425  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  44.82 
 
 
774 aa  394  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  41.86 
 
 
788 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  40.36 
 
 
779 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  43.13 
 
 
788 aa  388  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  40.29 
 
 
778 aa  384  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  39.23 
 
 
793 aa  371  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 
775 aa  366  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  41.09 
 
 
791 aa  353  7e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  39.95 
 
 
781 aa  334  4e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  40.8 
 
 
810 aa  310  8e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
716 aa  93.6  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
682 aa  87.8  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 
693 aa  79.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 
722 aa  73.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  31.15 
 
 
615 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 
675 aa  64.7  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
554 aa  63.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  23.19 
 
 
604 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  22.7 
 
 
564 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.21 
 
 
607 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  20.6 
 
 
735 aa  52  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  21.65 
 
 
604 aa  51.2  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 
627 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 
597 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 
567 aa  48.5  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 
535 aa  47.8  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
532 aa  47.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.39 
 
 
587 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2856  putative oligopeptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.33 
 
 
603 aa  44.3  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 
514 aa  44.3  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>