57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0778 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
778 aa  1550    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
779 aa  596  1e-169  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  43.96 
 
 
810 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 
791 aa  494  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  41.92 
 
 
788 aa  491  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  46.58 
 
 
774 aa  479  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  44.41 
 
 
781 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  39.72 
 
 
775 aa  455  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 
788 aa  450  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  41.21 
 
 
793 aa  446  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  46.09 
 
 
787 aa  441  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 
790 aa  415  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 
810 aa  395  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 
794 aa  390  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  40.72 
 
 
821 aa  363  5.0000000000000005e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
557 aa  94.7  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
557 aa  91.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 
722 aa  78.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 
693 aa  77.4  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  22.31 
 
 
735 aa  74.3  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 
675 aa  71.2  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 
682 aa  70.9  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.82 
 
 
607 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  22.09 
 
 
628 aa  65.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  21.41 
 
 
580 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
560 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  32.17 
 
 
615 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  20.77 
 
 
587 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
716 aa  56.6  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 
547 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  22.11 
 
 
596 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  21.48 
 
 
592 aa  54.7  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 
537 aa  54.7  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.92 
 
 
627 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 
581 aa  52.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  36.36 
 
 
580 aa  52  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
626 aa  51.2  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
636 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  21.82 
 
 
572 aa  50.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
578 aa  50.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  20.51 
 
 
564 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.34 
 
 
580 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  26.34 
 
 
579 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  32.53 
 
 
604 aa  47.8  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 
559 aa  47.8  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
629 aa  47.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 
557 aa  47.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
510 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 
539 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  33.01 
 
 
634 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  21.71 
 
 
553 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 
620 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
578 aa  45.8  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 
567 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  22.83 
 
 
616 aa  45.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
512 aa  45.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
552 aa  44.3  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>