148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4448 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  76.49 
 
 		 604 aa  1007    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  83.28 
 
 		 604 aa  1073    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 604 aa  1252    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 		 587 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 628 aa  115  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 567 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3888  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.170596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 		 621 aa  94.4  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3887  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 601 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.544175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  22.09 
 
 		 675 aa  77.4  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 		 735 aa  76.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 559 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  21.73 
 
 		 693 aa  67.4  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  21.23 
 
 		 603 aa  67  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3340  4-phytase  22.8 
 
 		 608 aa  64.7  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 		 596 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.16 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3648  extracellular solute-binding protein family 5  22.78 
 
 		 556 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  20.96 
 
 		 559 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 568 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  21.64 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.52 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  21.73 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 526 aa  57  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.58 
 
 		 506 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  20.55 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  20.39 
 
 		 788 aa  57  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  21.4 
 
 		 604 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  21.96 
 
 		 505 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3112  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 505 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 530 aa  54.7  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 774 aa  54.7  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 682 aa  54.3  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 509 aa  54.3  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  21.4 
 
 		 629 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 580 aa  54.3  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 567 aa  53.9  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  20.96 
 
 		 609 aa  53.9  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  23.58 
 
 		 693 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  20.77 
 
 		 547 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.08 
 
 		 588 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 575 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  21.19 
 
 		 604 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.54 
 
 		 521 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 521 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 779 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 534 aa  53.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  22.31 
 
 		 592 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 535 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 522 aa  51.6  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 788 aa  50.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  21.89 
 
 		 631 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.29 
 
 		 544 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4083  twin-arginine translocation pathway signal  22.37 
 
 		 626 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2491  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 592 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 575 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 781 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  21.48 
 
 		 531 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  21.32 
 
 		 513 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.25 
 
 		 575 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  21.24 
 
 		 565 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  22.79 
 
 		 532 aa  49.3  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 810 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  21.46 
 
 		 587 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  22.49 
 
 		 575 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  21.22 
 
 		 615 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 512 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 536 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  21.31 
 
 		 523 aa  48.9  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 810 aa  48.9  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  22.57 
 
 		 575 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.35 
 
 		 511 aa  48.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.57 
 
 		 609 aa  48.1  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  19.42 
 
 		 794 aa  48.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  21.5 
 
 		 530 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.11 
 
 		 593 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  21.12 
 
 		 608 aa  48.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 778 aa  47.4  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  23.01 
 
 		 565 aa  47.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.75 
 
 		 528 aa  47.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.47 
 
 		 562 aa  47.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.43 
 
 		 593 aa  47  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  18.75 
 
 		 514 aa  47  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  20.09 
 
 		 525 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  22.33 
 
 		 559 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 775 aa  47  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  20.96 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>