159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4466 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
564 aa  1163    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  33.88 
 
 
628 aa  222  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 
587 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 
735 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 
621 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 
603 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 
567 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 
693 aa  131  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 
604 aa  113  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
604 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  23.97 
 
 
604 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  22.81 
 
 
675 aa  91.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
693 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.51 
 
 
607 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
616 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 
615 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  22.87 
 
 
592 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
774 aa  71.2  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
781 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  21.65 
 
 
596 aa  70.5  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 
579 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
788 aa  70.1  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3888  extracellular solute-binding protein family 5  22.39 
 
 
589 aa  67.8  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.170596  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3887  extracellular solute-binding protein family 5  22.16 
 
 
601 aa  67.4  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.544175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2119  hypothetical protein  25.65 
 
 
729 aa  67  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 
616 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
559 aa  64.3  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 
788 aa  61.6  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
531 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.47 
 
 
545 aa  61.2  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
810 aa  61.2  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 
557 aa  60.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 
525 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 
557 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 
560 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
566 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 
567 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 
557 aa  58.9  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.97 
 
 
579 aa  58.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.53 
 
 
609 aa  57.4  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 
547 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.46 
 
 
492 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
559 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.46 
 
 
479 aa  55.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.26 
 
 
572 aa  55.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
557 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  22.58 
 
 
512 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 
775 aa  54.7  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
548 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
492 aa  54.3  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
548 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 
588 aa  53.9  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 
489 aa  53.9  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  20.63 
 
 
793 aa  53.9  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 
655 aa  53.9  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 
821 aa  53.5  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  20.57 
 
 
810 aa  53.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 
553 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 
540 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 
512 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
636 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  21 
 
 
794 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  18.82 
 
 
627 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  22.69 
 
 
536 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  21.84 
 
 
546 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
520 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
587 aa  51.2  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  28.89 
 
 
557 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 
562 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1451  ABC peptide/nickel/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.04 
 
 
524 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.482227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0100  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
524 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 
556 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  23.42 
 
 
528 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 
573 aa  51.2  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
507 aa  50.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  20.51 
 
 
778 aa  50.8  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.9 
 
 
525 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
510 aa  50.4  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.82 
 
 
520 aa  50.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  20.38 
 
 
519 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
507 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  23.56 
 
 
519 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  22.35 
 
 
516 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  20.67 
 
 
533 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  21.69 
 
 
532 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
534 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.5 
 
 
556 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 
534 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  19.42 
 
 
790 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4619  4-phytase  24.32 
 
 
544 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 
548 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  23 
 
 
503 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
520 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
520 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 
682 aa  48.9  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5016  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
475 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
520 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3602  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
539 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170805  hitchhiker  0.00309347 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>