More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0617 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
596 aa  1231    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  39.86 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  33.17 
 
 
616 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 
675 aa  213  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  22.8 
 
 
587 aa  97.8  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
616 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.04 
 
 
545 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  22.09 
 
 
562 aa  87.8  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
565 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  22.48 
 
 
557 aa  84  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  21.19 
 
 
561 aa  84  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.47 
 
 
607 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.07 
 
 
563 aa  82.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.78 
 
 
609 aa  80.9  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
781 aa  79.3  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.74 
 
 
627 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 
615 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.14 
 
 
564 aa  77.8  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 
597 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
551 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  22.66 
 
 
621 aa  76.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  21.5 
 
 
628 aa  75.1  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.85 
 
 
546 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  22.81 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  20.81 
 
 
603 aa  74.3  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 
791 aa  73.6  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  22.73 
 
 
560 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
524 aa  72.8  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
604 aa  72  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 
547 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
788 aa  71.2  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  22.69 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.23 
 
 
556 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
604 aa  71.2  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  21.73 
 
 
787 aa  70.5  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  22.34 
 
 
577 aa  70.5  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  21.65 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
559 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
557 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.33 
 
 
520 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.1 
 
 
540 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
595 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 
793 aa  67  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 
551 aa  67.4  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 
531 aa  67.4  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 
557 aa  67  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
735 aa  66.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1093  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
629 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0361636  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  21.99 
 
 
548 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.75 
 
 
538 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  23.44 
 
 
560 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 
591 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  21.75 
 
 
693 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  22.05 
 
 
548 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  22.11 
 
 
569 aa  65.1  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.35 
 
 
524 aa  64.7  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.77 
 
 
593 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.93 
 
 
542 aa  64.7  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  23.94 
 
 
517 aa  64.7  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  27.13 
 
 
562 aa  64.3  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 
604 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  20.82 
 
 
551 aa  64.3  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 
579 aa  64.3  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  21.04 
 
 
693 aa  63.9  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.25 
 
 
532 aa  63.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.59 
 
 
593 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  19.25 
 
 
548 aa  63.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.59 
 
 
593 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 
526 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  19.8 
 
 
567 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  23.58 
 
 
580 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  23.58 
 
 
579 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.59 
 
 
593 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  21.54 
 
 
525 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  22.06 
 
 
579 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 
540 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.43 
 
 
510 aa  62  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  22.3 
 
 
568 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 
604 aa  62  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 
609 aa  62.4  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.5 
 
 
593 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  20.81 
 
 
588 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.98 
 
 
545 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 
775 aa  61.6  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2800  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
630 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  21.15 
 
 
553 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.88 
 
 
552 aa  61.6  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  21.82 
 
 
554 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
538 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.45 
 
 
587 aa  60.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  22.09 
 
 
645 aa  60.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  21.56 
 
 
579 aa  60.5  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
534 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
517 aa  60.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.32 
 
 
593 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  23.43 
 
 
538 aa  60.1  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>