104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0232 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 787 aa  1559    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  50.58 
 
 		 788 aa  600  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  46.85 
 
 		 810 aa  590  1e-167  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  48.05 
 
 		 793 aa  581  1e-164  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  48.01 
 
 		 791 aa  560  1e-158  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  51.39 
 
 		 774 aa  556  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  46.98 
 
 		 788 aa  538  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  43.99 
 
 		 775 aa  506  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  41.85 
 
 		 781 aa  495  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 		 794 aa  479  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  44.18 
 
 		 779 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  41 
 
 		 778 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  41.06 
 
 		 790 aa  434  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  40.59 
 
 		 821 aa  413  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 		 810 aa  388  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 716 aa  97.4  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.580792 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 		 693 aa  88.6  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 682 aa  86.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  21.73 
 
 		 596 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 		 615 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  22.05 
 
 		 735 aa  67  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  22.72 
 
 		 675 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 628 aa  63.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.16 
 
 		 607 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  21.34 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 597 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  21.19 
 
 		 568 aa  57.4  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.15 
 
 		 581 aa  56.6  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  22.87 
 
 		 524 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  21.81 
 
 		 627 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 503 aa  55.1  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 		 722 aa  55.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 557 aa  54.7  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 557 aa  54.3  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2987  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.83 
 
 		 543 aa  54.3  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 500 aa  53.9  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.1 
 
 		 588 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  21.3 
 
 		 569 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 604 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 		 604 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 657 aa  51.6  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01271  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  22.97 
 
 		 547 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2352  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 		 547 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1046  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 675 aa  51.6  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1408  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.97 
 
 		 547 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01282  hypothetical protein  22.97 
 
 		 547 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856831  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 594 aa  51.2  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0753  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 685 aa  51.2  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.371532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  23.9 
 
 		 537 aa  50.8  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  21.47 
 
 		 547 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  22.36 
 
 		 592 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1501  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.67 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2331  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1530  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.67 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.414717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 		 620 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  27.69 
 
 		 560 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.53 
 
 		 525 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 621 aa  50.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  20.68 
 
 		 565 aa  49.7  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 		 579 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.86 
 
 		 587 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 		 579 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 567 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 582 aa  48.9  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 606 aa  48.9  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1828  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.38 
 
 		 539 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.011145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1816  peptide transport periplasmic protein SapA  21.07 
 
 		 549 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.440252  hitchhiker  0.00000000112139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  21.07 
 
 		 549 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1640  peptide transport periplasmic protein SapA  21.07 
 
 		 549 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.53 
 
 		 539 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.101699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.8 
 
 		 545 aa  48.5  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1878  peptide transport periplasmic protein SapA  20.47 
 
 		 557 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 		 514 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 550 aa  47.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  22.33 
 
 		 567 aa  47.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.2 
 
 		 556 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 657 aa  47.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 595 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 518 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  23.84 
 
 		 541 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 607 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1458  peptide transport periplasmic protein SapA  20.82 
 
 		 549 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  20.95 
 
 		 580 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.51 
 
 		 563 aa  46.6  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 560 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 		 521 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 553 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 735 aa  45.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 541 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 		 517 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.75 
 
 		 551 aa  45.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 591 aa  45.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1930  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 		 499 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 541 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  21.95 
 
 		 528 aa  44.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  23.08 
 
 		 555 aa  44.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 576 aa  44.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.94 
 
 		 520 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  31.08 
 
 		 560 aa  44.3  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>